More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0653 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  70.15 
 
 
583 aa  877    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  70.84 
 
 
583 aa  893    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1086  aspartyl-tRNA synthetase  74.66 
 
 
580 aa  915    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.989132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1981  aspartyl-tRNA synthetase  71.7 
 
 
585 aa  901    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000379313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0653  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
582 aa  1194    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0244847  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  70.5 
 
 
583 aa  883    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  69.81 
 
 
583 aa  874    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0296  aspartyl-tRNA synthetase  68.1 
 
 
584 aa  856    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  69.19 
 
 
584 aa  871    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
594 aa  627  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 
598 aa  623  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
594 aa  619  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
599 aa  616  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
597 aa  618  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
617 aa  615  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
601 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
627 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
593 aa  614  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
585 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
593 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
599 aa  609  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
590 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
594 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
589 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
610 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
591 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
591 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
591 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
591 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 
602 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
591 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
599 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
591 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 
591 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
591 aa  601  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
606 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
592 aa  601  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 
597 aa  598  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
594 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
591 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
591 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
596 aa  596  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 
591 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 
590 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
613 aa  598  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
593 aa  595  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
593 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
595 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
591 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
592 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
591 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
601 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
599 aa  591  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
588 aa  591  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
591 aa  591  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
591 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
608 aa  588  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
588 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
599 aa  588  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
592 aa  585  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
608 aa  587  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
602 aa  585  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
588 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
592 aa  587  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
614 aa  586  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
599 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
596 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1898  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0452698  hitchhiker  0.00737788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2080  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
591 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108911  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
590 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
607 aa  582  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
592 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000667018  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
594 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2114  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
601 aa  579  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454587  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
596 aa  581  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
601 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2040  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
592 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00291501  hitchhiker  0.000000115872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
593 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
586 aa  581  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
594 aa  581  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
592 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000241226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
605 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
600 aa  575  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 
600 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
596 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
611 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1887  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
593 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00122802  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
596 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
592 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
600 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>