More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0829 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0829  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
582 aa  1204    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0763461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
590 aa  611  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
592 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
593 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 
593 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
594 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
602 aa  593  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
593 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
594 aa  588  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 
598 aa  588  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
592 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
596 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
598 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
589 aa  583  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
594 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
597 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
594 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
600 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
585 aa  579  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
600 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
591 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
613 aa  576  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
589 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
591 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
591 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
591 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
590 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
597 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
627 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
591 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
591 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
591 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
591 aa  569  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
595 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
594 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
601 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
586 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
591 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
603 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
608 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
597 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
588 aa  557  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
597 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
600 aa  554  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
592 aa  551  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
589 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
587 aa  555  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
593 aa  550  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
610 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
602 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
596 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
596 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
583 aa  542  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
588 aa  544  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
594 aa  545  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
583 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
606 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1086  aspartyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
580 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.989132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
600 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
600 aa  541  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
583 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
589 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
584 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
619 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
599 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
597 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
599 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  47 
 
 
583 aa  537  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
588 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
592 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
588 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
599 aa  535  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
597 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
595 aa  535  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
594 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
617 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
598 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
595 aa  534  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1067  aspartyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
587 aa  532  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
591 aa  535  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
617 aa  533  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
607 aa  534  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
587 aa  530  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
614 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
588 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
594 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
600 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
598 aa  526  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
590 aa  526  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
583 aa  525  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
596 aa  525  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
598 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1353  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
579 aa  526  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000395014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0653  aspartyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
582 aa  526  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0244847  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
583 aa  528  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
590 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
594 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
608 aa  524  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>