More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1217 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  63.93 
 
 		 587 aa  795    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 		 581 aa  807    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4178  aspartyl-tRNA synthetase  67.29 
 
 		 589 aa  837    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01940  aspartyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 582 aa  781    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.425315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0111  aspartyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 616 aa  772    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4606  aspartyl-tRNA synthetase  65.03 
 
 		 589 aa  811    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1217  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 582 aa  1211    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000515713 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  63.87 
 
 		 582 aa  796    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1248  aspartyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 583 aa  760    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0148  aspartyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 		 582 aa  740    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 592 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 593 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 627 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 589 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 597 aa  594  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 594 aa  589  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 600 aa  588  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 594 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 591 aa  586  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 591 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 596 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 592 aa  586  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 595 aa  587  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 600 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 586 aa  585  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 591 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 600 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 606 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 598 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 601 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 593 aa  581  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 598 aa  580  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 591 aa  581  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 590 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 610 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 593 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 593 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 608 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 583 aa  569  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1067  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 587 aa  570  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 591 aa  571  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 589 aa  571  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 598 aa  568  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 597 aa  568  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 597 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 614 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 589 aa  561  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 585 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 588 aa  560  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 588 aa  561  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 590 aa  561  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 589 aa  558  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 583 aa  559  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 588 aa  560  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 588 aa  561  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 594 aa  556  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 594 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 597 aa  552  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 582 aa  554  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 619 aa  551  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 602 aa  551  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 602 aa  548  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 597 aa  547  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 590 aa  545  1e-154  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 592 aa  542  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 579 aa  544  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 597 aa  544  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 599 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 594 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 613 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1230  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 576 aa  541  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 594 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 592 aa  538  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 578 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1353  aspartyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 579 aa  537  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000395014  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 610 aa  535  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 600 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 599 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 599 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 605 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 592 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 599 aa  532  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 618 aa  533  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 599 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 599 aa  534  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 599 aa  532  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 592 aa  535  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 587 aa  535  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 609 aa  533  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 599 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 602 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 623 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 617 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>