More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4606 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  66.89 
 
 		 587 aa  823    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  72.04 
 
 		 581 aa  884    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1248  aspartyl-tRNA synthetase  65.75 
 
 		 583 aa  817    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0148  aspartyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 		 582 aa  745    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4178  aspartyl-tRNA synthetase  78.6 
 
 		 589 aa  969    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0111  aspartyl-tRNA synthetase  74.66 
 
 		 616 aa  921    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1217  aspartyl-tRNA synthetase  65.03 
 
 		 582 aa  811    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000515713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4606  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 589 aa  1209    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  67.18 
 
 		 582 aa  832    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01940  aspartyl-tRNA synthetase  63.87 
 
 		 582 aa  797    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.425315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 596 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 592 aa  616  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 598 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 593 aa  608  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 589 aa  608  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 593 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 591 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 591 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 593 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 594 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 594 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 593 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 594 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 600 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 598 aa  594  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 591 aa  587  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 589 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 594 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 594 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 589 aa  582  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 619 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 608 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 590 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 595 aa  580  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 600 aa  579  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 627 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 592 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 588 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 600 aa  574  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 586 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 613 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 589 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 602 aa  570  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 597 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 597 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 597 aa  568  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 583 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 598 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 610 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 597 aa  561  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 606 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 602 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 590 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 585 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 588 aa  554  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 594 aa  552  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 601 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 614 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 583 aa  551  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 588 aa  545  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 597 aa  546  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 614 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 588 aa  545  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 597 aa  541  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 599 aa  541  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 594 aa  544  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 592 aa  544  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 594 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 598 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 587 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1067  aspartyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 587 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 599 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 626 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 599 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0323  aspartyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 575 aa  535  1e-151  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 595 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1137  aspartyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 597 aa  536  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000518109  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 598 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 595 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 590 aa  536  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 598 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 597 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 599 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 598 aa  532  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 603 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 601 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 582 aa  530  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 594 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 596 aa  528  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 592 aa  527  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 588 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 599 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 592 aa  528  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>