More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0323 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl365  aspartyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 
577 aa  772    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000185731  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0323  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
575 aa  1179    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
592 aa  549  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
594 aa  551  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
583 aa  546  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
582 aa  548  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
602 aa  543  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
596 aa  542  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
627 aa  541  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
593 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
583 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
598 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4606  aspartyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
589 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
592 aa  540  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
594 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
595 aa  535  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
610 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0284  aspartyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
578 aa  535  1e-151  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
585 aa  532  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
593 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1122  aspartyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
577 aa  532  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1217  aspartyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
582 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000515713 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
617 aa  534  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
602 aa  533  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
594 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
594 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
581 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01940  aspartyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
582 aa  529  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.425315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
593 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
582 aa  531  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
614 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1230  aspartyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
576 aa  530  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
587 aa  527  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
589 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
594 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
606 aa  527  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
619 aa  528  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
588 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
588 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
591 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
591 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
591 aa  522  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
590 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
591 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
591 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
593 aa  524  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
600 aa  519  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
591 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
591 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
591 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
591 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
598 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
590 aa  518  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
600 aa  518  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
595 aa  518  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
613 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
588 aa  514  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
600 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
584 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1248  aspartyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
583 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
597 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
597 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
597 aa  512  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
593 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
608 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
597 aa  510  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0148  aspartyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
582 aa  509  1e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2533  aspartyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
603 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465887  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1316  aspartyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
603 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
591 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1418  aspartyl-tRNA synthetase  43 
 
 
603 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
597 aa  505  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
593 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1620  aspartyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
581 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
600 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4178  aspartyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
589 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0111  aspartyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
616 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
590 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
585 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
598 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1067  aspartyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
587 aa  503  1e-141  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
599 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
586 aa  502  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
578 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
579 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
601 aa  500  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
589 aa  500  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
592 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1329  aspartyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
616 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519796  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1223  aspartyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
585 aa  499  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1353  aspartyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
579 aa  500  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000395014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
590 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
594 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
588 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
614 aa  495  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
590 aa  495  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
590 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
590 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
594 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
590 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>