More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1418 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 594 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1316  aspartyl-tRNA synthetase  99.34 
 
 		 603 aa  1235    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1329  aspartyl-tRNA synthetase  90.2 
 
 		 616 aa  1154    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519796  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 618 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 596 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 594 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2533  aspartyl-tRNA synthetase  98.84 
 
 		 603 aa  1228    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 593 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  53.34 
 
 		 593 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1418  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 603 aa  1242    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 598 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 594 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 593 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 592 aa  624  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 627 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 606 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 597 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 594 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 610 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 600 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 598 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 585 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 602 aa  598  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 614 aa  599  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 619 aa  598  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 613 aa  596  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 595 aa  592  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 598 aa  594  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 590 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 607 aa  585  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 600 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 597 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 592 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 599 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 597 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 589 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 594 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 590 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 608 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0582  aspartyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 599 aa  570  1e-161  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 594 aa  571  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 601 aa  570  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 591 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 600 aa  566  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 597 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 591 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 599 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 594 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 600 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 597 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 623 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 602 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 591 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 605 aa  561  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 599 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 589 aa  560  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 588 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 599 aa  555  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 594 aa  555  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 595 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 617 aa  557  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 592 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 592 aa  555  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 602 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 589 aa  551  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 602 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 600 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 599 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 600 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 591 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 593 aa  549  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 600 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 600 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 597 aa  551  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 590 aa  551  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 600 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 594 aa  551  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 599 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 588 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 600 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 586 aa  551  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 600 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 600 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 600 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 592 aa  550  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 588 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 600 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 600 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 601 aa  548  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 599 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 588 aa  545  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 600 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>