More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2053 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  68.6 
 
 		 591 aa  817    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  84.88 
 
 		 578 aa  1019    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  67.52 
 
 		 609 aa  809    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 1019 aa  796    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  67.34 
 
 		 598 aa  810    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  65.93 
 
 		 590 aa  800    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  72.51 
 
 		 584 aa  872    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  75.69 
 
 		 579 aa  904    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 584 aa  1190    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  63.94 
 
 		 601 aa  775    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  68.31 
 
 		 607 aa  830    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  69.44 
 
 		 592 aa  839    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  80 
 
 		 585 aa  956    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  68.32 
 
 		 591 aa  803    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  70.86 
 
 		 586 aa  857    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 601 aa  788    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  65.76 
 
 		 592 aa  801    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  66.1 
 
 		 599 aa  800    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  65.66 
 
 		 600 aa  789    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  65.93 
 
 		 599 aa  800    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  65.97 
 
 		 572 aa  764    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 		 590 aa  783    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  57.94 
 
 		 598 aa  701    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 600 aa  800    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  64.61 
 
 		 604 aa  793    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  64.25 
 
 		 590 aa  768    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 		 596 aa  776    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 596 aa  794    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 599 aa  718    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  72.42 
 
 		 592 aa  848    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  69.05 
 
 		 590 aa  814    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 		 590 aa  783    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  65.2 
 
 		 601 aa  776    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  70.05 
 
 		 590 aa  862    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  68.42 
 
 		 604 aa  832    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 610 aa  822    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 590 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 627 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 594 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 592 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 586 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 598 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 594 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 602 aa  595  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 599 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 592 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 614 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 597 aa  589  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 606 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 599 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01837  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01825  hypothetical protein  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.765739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 599 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 590 aa  588  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 590 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 601 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 610 aa  588  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 601 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 590 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 592 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 600 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 594 aa  583  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 618 aa  579  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 591 aa  579  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 585 aa  581  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 596 aa  578  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 602 aa  578  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 593 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 591 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 596 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 591 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 591 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 596 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 613 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 591 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 608 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 593 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 617 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2262  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 596 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.410754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 591 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 598 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 591 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 598 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2160  aspartyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 601 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 598 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>