More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3164 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  63.52 
 
 		 610 aa  774    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  66.06 
 
 		 607 aa  803    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  68.32 
 
 		 584 aa  803    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 		 601 aa  778    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  64.15 
 
 		 609 aa  772    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  62.31 
 
 		 592 aa  763    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 604 aa  763    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  64.26 
 
 		 1019 aa  747    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  65.45 
 
 		 579 aa  779    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  63.9 
 
 		 590 aa  773    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  58.64 
 
 		 598 aa  709    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  64.19 
 
 		 596 aa  778    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  65.1 
 
 		 584 aa  761    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  62.99 
 
 		 590 aa  740    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  65.72 
 
 		 604 aa  803    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  66.5 
 
 		 591 aa  774    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 		 578 aa  806    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  63.67 
 
 		 601 aa  759    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  64.97 
 
 		 590 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  63.93 
 
 		 598 aa  764    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  63.81 
 
 		 572 aa  751    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 600 aa  778    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 		 586 aa  796    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 599 aa  706    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  64.21 
 
 		 599 aa  778    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  62.18 
 
 		 600 aa  738    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 592 aa  806    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  62.42 
 
 		 596 aa  759    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 585 aa  776    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 592 aa  768    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  68.72 
 
 		 590 aa  838    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  64.22 
 
 		 590 aa  761    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  63.9 
 
 		 590 aa  774    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 591 aa  1188    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  63.9 
 
 		 601 aa  778    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  63.31 
 
 		 599 aa  763    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 590 aa  561  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 602 aa  558  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 596 aa  555  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 598 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 600 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 594 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 597 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 594 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 596 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 594 aa  537  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 596 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 594 aa  535  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 599 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 599 aa  531  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 592 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 592 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 599 aa  528  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 617 aa  528  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 592 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 594 aa  527  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 613 aa  525  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 597 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 596 aa  522  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 593 aa  522  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 586 aa  522  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 601 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 591 aa  524  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2047  aspartyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 580 aa  522  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0219169  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 598 aa  525  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 591 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2114  aspartyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 601 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454587  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 599 aa  519  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 591 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 600 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 591 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 590 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 595 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 591 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 590 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 591 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 590 aa  515  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 597 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 598 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 593 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 608 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 596 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 598 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 591 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 597 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 597 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2160  aspartyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 601 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 618 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 592 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 593 aa  512  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 598 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 614 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 594 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0692  aspartyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 620 aa  514  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 595 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163507  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 583 aa  513  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0582  aspartyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 599 aa  512  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 627 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1751  aspartyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 590 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000012582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>