More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1809 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  72.96 
 
 		 590 aa  897    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  81.97 
 
 		 600 aa  976    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  62.8 
 
 		 584 aa  748    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  77.59 
 
 		 592 aa  954    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  63.16 
 
 		 598 aa  771    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 585 aa  792    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  63.84 
 
 		 579 aa  773    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  83.79 
 
 		 590 aa  993    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  69.22 
 
 		 578 aa  839    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 		 586 aa  789    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  73.83 
 
 		 601 aa  898    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  73.06 
 
 		 599 aa  898    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  74.5 
 
 		 604 aa  897    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  75.09 
 
 		 609 aa  897    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  75.04 
 
 		 600 aa  892    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  75.59 
 
 		 592 aa  901    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  73.58 
 
 		 598 aa  889    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  72.43 
 
 		 572 aa  835    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  67.28 
 
 		 604 aa  800    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  72.25 
 
 		 590 aa  858    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  71.99 
 
 		 590 aa  855    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  65.2 
 
 		 1019 aa  775    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  68.6 
 
 		 584 aa  830    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 591 aa  1184    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 599 aa  784    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  73.19 
 
 		 596 aa  898    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  67.11 
 
 		 607 aa  800    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  65.89 
 
 		 592 aa  776    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  74.58 
 
 		 610 aa  904    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  75.13 
 
 		 590 aa  883    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  66.5 
 
 		 591 aa  787    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  72.08 
 
 		 590 aa  856    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  70.66 
 
 		 596 aa  847    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  71.19 
 
 		 601 aa  848    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  79.6 
 
 		 601 aa  942    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  74.03 
 
 		 599 aa  885    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 590 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 594 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 596 aa  574  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 600 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 594 aa  571  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 592 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 586 aa  571  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 599 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 599 aa  568  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 602 aa  568  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 592 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 605 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 597 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 594 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 598 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 627 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 596 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 595 aa  559  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 591 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 591 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 599 aa  557  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 591 aa  555  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 591 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 606 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 599 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 591 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 623 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 623 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 600 aa  558  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 591 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 617 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 589 aa  552  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 591 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 591 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 600 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 597 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 595 aa  555  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 600 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 596 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 600 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 600 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 596 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 600 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 591 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 584 aa  554  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 610 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 591 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 600 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 600 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 591 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 600 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 598 aa  551  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000444023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 599 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 599 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 600 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 601 aa  551  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 598 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 599 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>