More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_12790 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  74.3 
 
 
592 aa  898    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  69.73 
 
 
590 aa  847    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  72.02 
 
 
598 aa  876    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 
591 aa  763    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  73.3 
 
 
600 aa  891    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  60.93 
 
 
598 aa  751    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 
586 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  61.68 
 
 
579 aa  760    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  74.5 
 
 
591 aa  882    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  68.21 
 
 
596 aa  828    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  72.62 
 
 
590 aa  880    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 
599 aa  745    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  74.84 
 
 
610 aa  923    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  69.26 
 
 
599 aa  832    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  70.34 
 
 
572 aa  828    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  66.34 
 
 
607 aa  787    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  65.21 
 
 
585 aa  778    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  71.07 
 
 
600 aa  872    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  74.63 
 
 
609 aa  911    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  70.69 
 
 
590 aa  859    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
604 aa  1222    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  65.38 
 
 
578 aa  801    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  73.08 
 
 
592 aa  898    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  80.64 
 
 
599 aa  979    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  71.64 
 
 
601 aa  880    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  73.15 
 
 
601 aa  895    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  65.35 
 
 
604 aa  781    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  79.63 
 
 
596 aa  980    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 
1019 aa  783    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  63.48 
 
 
592 aa  757    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  73.91 
 
 
590 aa  887    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  69.73 
 
 
590 aa  847    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  69.01 
 
 
601 aa  843    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  59.5 
 
 
584 aa  727    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  72.48 
 
 
590 aa  890    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  64.61 
 
 
584 aa  793    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
602 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
590 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
599 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
600 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
592 aa  569  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
594 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
586 aa  565  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
591 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 
585 aa  561  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
592 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
599 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
591 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
591 aa  558  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
592 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
594 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
591 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
594 aa  558  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
596 aa  557  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 
601 aa  555  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
590 aa  555  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
600 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
591 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
599 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
594 aa  555  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
591 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
617 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
606 aa  551  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
592 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
590 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
596 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
599 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
627 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
591 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
595 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
598 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
596 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
614 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
595 aa  548  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
596 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
594 aa  548  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
601 aa  548  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
610 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
605 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
601 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
623 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
623 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
597 aa  544  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
603 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
594 aa  543  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
588 aa  544  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0420  aspartyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
608 aa  543  1e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2047  aspartyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
580 aa  542  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0219169  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
594 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  47 
 
 
591 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
593 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
591 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
591 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
600 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
626 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
600 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
598 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>