More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3040 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  73.03 
 
 		 599 aa  890    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  75.59 
 
 		 590 aa  909    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  74.24 
 
 		 590 aa  897    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  68.14 
 
 		 585 aa  813    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 584 aa  780    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  73.3 
 
 		 600 aa  908    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  71.48 
 
 		 578 aa  857    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  65.42 
 
 		 579 aa  788    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  76.92 
 
 		 610 aa  961    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  65.55 
 
 		 1019 aa  774    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  73.49 
 
 		 592 aa  905    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  72.26 
 
 		 601 aa  884    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  70.95 
 
 		 609 aa  884    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  60.54 
 
 		 598 aa  747    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  74.87 
 
 		 592 aa  920    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  76.25 
 
 		 601 aa  929    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  68.47 
 
 		 586 aa  823    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  73.68 
 
 		 590 aa  904    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 598 aa  1211    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  67.34 
 
 		 584 aa  819    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  75.52 
 
 		 572 aa  884    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  72.03 
 
 		 600 aa  879    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  63.93 
 
 		 591 aa  780    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  73.58 
 
 		 591 aa  898    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  67.6 
 
 		 607 aa  808    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  75.89 
 
 		 590 aa  917    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  71.24 
 
 		 596 aa  873    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  73.66 
 
 		 596 aa  902    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  72.02 
 
 		 604 aa  891    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  61.05 
 
 		 599 aa  752    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 		 604 aa  804    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  67.28 
 
 		 592 aa  796    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  76.06 
 
 		 590 aa  913    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  73.48 
 
 		 599 aa  894    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  75.42 
 
 		 590 aa  907    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  74.24 
 
 		 601 aa  899    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 592 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 590 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 586 aa  568  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 594 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 597 aa  565  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 599 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 591 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 602 aa  560  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 594 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 591 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 591 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 592 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 594 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 591 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 600 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 596 aa  552  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 591 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 596 aa  550  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 599 aa  548  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 592 aa  548  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 598 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 608 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 617 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 594 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 606 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 599 aa  549  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 626 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 598 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 594 aa  551  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 594 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 627 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 614 aa  545  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 599 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 590 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 594 aa  545  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 593 aa  545  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 591 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4178  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 589 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 591 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 585 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2047  aspartyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 580 aa  545  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0219169  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 623 aa  545  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 596 aa  542  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 598 aa  542  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 602 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 597 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 602 aa  545  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 595 aa  543  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 596 aa  542  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 590 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 584 aa  542  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 623 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2262  aspartyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 596 aa  544  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.410754  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 614 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 601 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 592 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 601 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 599 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2160  aspartyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 601 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 593 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>