More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  74.54 
 
 		 592 aa  902    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  73.45 
 
 		 599 aa  900    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  74.62 
 
 		 599 aa  887    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 586 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  80.17 
 
 		 592 aa  988    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  71.09 
 
 		 590 aa  879    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  65.93 
 
 		 584 aa  811    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  63.54 
 
 		 579 aa  775    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  69.34 
 
 		 578 aa  836    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  75 
 
 		 610 aa  928    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  72.25 
 
 		 590 aa  860    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  64.69 
 
 		 598 aa  788    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  72.62 
 
 		 604 aa  897    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 599 aa  801    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  62.99 
 
 		 591 aa  755    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  65.76 
 
 		 585 aa  793    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  65.27 
 
 		 1019 aa  766    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  72 
 
 		 572 aa  827    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  74.83 
 
 		 601 aa  893    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  74.24 
 
 		 598 aa  900    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 		 607 aa  788    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  66.89 
 
 		 604 aa  790    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 584 aa  740    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  71.53 
 
 		 609 aa  866    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  71.84 
 
 		 590 aa  849    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 		 596 aa  837    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  74.45 
 
 		 600 aa  891    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 590 aa  1190    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  73.68 
 
 		 596 aa  899    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 		 592 aa  748    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  85.37 
 
 		 600 aa  1023    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  74.53 
 
 		 590 aa  886    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  71.84 
 
 		 590 aa  849    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  71.79 
 
 		 601 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  83.79 
 
 		 591 aa  995    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  82.8 
 
 		 601 aa  992    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 590 aa  588  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 600 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 594 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 586 aa  581  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 599 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 599 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 592 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 602 aa  569  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 626 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 614 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 598 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 595 aa  566  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 594 aa  568  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 597 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 585 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 627 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 593 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 592 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 594 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 591 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 599 aa  561  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 600 aa  559  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 610 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 592 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 596 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 605 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 597 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 596 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 606 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 623 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 617 aa  555  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 601 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 599 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 598 aa  557  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 623 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 599 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 594 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 591 aa  552  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 591 aa  552  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 591 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 591 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 591 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 591 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 600 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 602 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 597 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 597 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 590 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 614 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 600 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 618 aa  550  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 591 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 591 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 602 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 594 aa  551  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 591 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 591 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 591 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 619 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 598 aa  551  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 594 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>