More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2398 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  76.06 
 
 		 598 aa  911    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  75.93 
 
 		 610 aa  929    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  72.13 
 
 		 601 aa  888    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  66.89 
 
 		 586 aa  806    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  64.22 
 
 		 591 aa  775    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  73.91 
 
 		 604 aa  902    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  64.05 
 
 		 579 aa  781    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  69.73 
 
 		 578 aa  839    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  74.53 
 
 		 590 aa  882    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  67.17 
 
 		 604 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  72.3 
 
 		 599 aa  895    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  71.94 
 
 		 592 aa  869    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  70.27 
 
 		 596 aa  856    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  65.09 
 
 		 1019 aa  773    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  75.13 
 
 		 591 aa  884    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  69.05 
 
 		 584 aa  833    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  64.96 
 
 		 584 aa  770    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  72.4 
 
 		 590 aa  882    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  60.81 
 
 		 599 aa  748    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  75.87 
 
 		 572 aa  884    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  74.62 
 
 		 600 aa  898    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  73.83 
 
 		 600 aa  907    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  61.32 
 
 		 598 aa  753    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  73.56 
 
 		 590 aa  889    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  73.51 
 
 		 592 aa  882    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  73.48 
 
 		 609 aa  901    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  75.08 
 
 		 590 aa  902    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  71.97 
 
 		 596 aa  885    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  73.88 
 
 		 601 aa  902    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  68.07 
 
 		 592 aa  804    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 590 aa  1203    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  69.68 
 
 		 585 aa  827    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  75.08 
 
 		 590 aa  902    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  72.5 
 
 		 601 aa  881    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  71.89 
 
 		 599 aa  857    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  67.33 
 
 		 607 aa  804    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 600 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 592 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 602 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 602 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 586 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 596 aa  570  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 598 aa  565  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 601 aa  566  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 597 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 600 aa  564  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 592 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 585 aa  561  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 594 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 594 aa  557  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 594 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 591 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 599 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 606 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 591 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 627 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 591 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 594 aa  553  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 591 aa  552  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 591 aa  555  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 591 aa  554  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 591 aa  552  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 589 aa  551  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 596 aa  551  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 591 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 594 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 591 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 591 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 597 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 599 aa  549  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 594 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 610 aa  548  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 598 aa  546  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 599 aa  547  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 608 aa  546  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 597 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 589 aa  545  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 608 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 591 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 608 aa  543  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 597 aa  545  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 590 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 595 aa  543  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 601 aa  541  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 590 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 584 aa  544  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 593 aa  542  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 614 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01552  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 588 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 591 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 594 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 599 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 591 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 591 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 591 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 594 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 599 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 593 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>