More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2308 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  70.34 
 
 		 604 aa  828    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 585 aa  758    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  71.05 
 
 		 599 aa  825    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  70.91 
 
 		 601 aa  808    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  75.26 
 
 		 592 aa  875    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  63.46 
 
 		 579 aa  735    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  86.69 
 
 		 590 aa  1022    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  65.05 
 
 		 604 aa  737    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  81.13 
 
 		 600 aa  954    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  73.29 
 
 		 590 aa  865    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  63.81 
 
 		 591 aa  751    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  99.65 
 
 		 590 aa  1154    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 		 607 aa  742    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  73.81 
 
 		 609 aa  852    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  72.95 
 
 		 600 aa  826    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  82.87 
 
 		 596 aa  971    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  59.93 
 
 		 598 aa  711    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  71.9 
 
 		 599 aa  846    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 572 aa  1159    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  75.52 
 
 		 598 aa  870    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  63.95 
 
 		 1019 aa  725    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  80.11 
 
 		 601 aa  947    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  63.16 
 
 		 584 aa  723    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 599 aa  711    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  72.43 
 
 		 591 aa  825    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  71.23 
 
 		 596 aa  826    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  64.1 
 
 		 586 aa  742    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  73.34 
 
 		 592 aa  847    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  66.2 
 
 		 592 aa  755    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  65.97 
 
 		 584 aa  764    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  75.87 
 
 		 590 aa  872    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  73.31 
 
 		 610 aa  862    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  99.83 
 
 		 590 aa  1157    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  72 
 
 		 590 aa  806    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  86.64 
 
 		 601 aa  1022    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  68.76 
 
 		 578 aa  793    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 590 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 598 aa  558  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 600 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 597 aa  555  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 600 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 592 aa  548  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 594 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 596 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 592 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 601 aa  544  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 602 aa  543  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 596 aa  543  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 594 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 594 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 627 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 594 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 606 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 592 aa  533  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 598 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 591 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 586 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 591 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 593 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 586 aa  532  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 591 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 593 aa  531  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 589 aa  531  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 593 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 596 aa  529  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 592 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 594 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 608 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 602 aa  531  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 596 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 596 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 591 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 603 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 599 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 591 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2114  aspartyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 601 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 593 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 591 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 594 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 592 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 594 aa  526  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 588 aa  525  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 590 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2262  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 596 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.410754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 588 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 599 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 591 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 591 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 598 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 599 aa  525  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 589 aa  525  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 593 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 583 aa  524  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 617 aa  524  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 584 aa  522  1e-147  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 583 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 583 aa  521  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 601 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 593 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>