More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12592 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  70.81 
 
 		 610 aa  870    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  67.06 
 
 		 578 aa  809    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  71.09 
 
 		 590 aa  870    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  70.68 
 
 		 609 aa  849    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  70.69 
 
 		 592 aa  857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 596 aa  1204    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  78.57 
 
 		 600 aa  959    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  69.62 
 
 		 601 aa  825    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 579 aa  760    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 586 aa  752    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 		 584 aa  730    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  69.02 
 
 		 599 aa  832    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  82.88 
 
 		 590 aa  1000    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  59.23 
 
 		 598 aa  725    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  68.21 
 
 		 604 aa  828    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  70.66 
 
 		 591 aa  835    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  76.74 
 
 		 601 aa  937    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  80.68 
 
 		 590 aa  982    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  65.43 
 
 		 585 aa  778    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  70.71 
 
 		 600 aa  847    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  70.07 
 
 		 599 aa  832    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  82.87 
 
 		 572 aa  971    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  64.19 
 
 		 591 aa  778    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  64.94 
 
 		 607 aa  763    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  62.37 
 
 		 1019 aa  727    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 		 584 aa  776    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 		 592 aa  841    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  69.88 
 
 		 596 aa  837    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 599 aa  728    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 		 592 aa  764    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  70.27 
 
 		 590 aa  843    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  82.71 
 
 		 590 aa  998    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  81.34 
 
 		 601 aa  1001    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 		 590 aa  816    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 604 aa  758    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  71.24 
 
 		 598 aa  858    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 600 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 590 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 594 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 591 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 591 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 591 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 594 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 591 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 597 aa  556  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 590 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 598 aa  557  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 592 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 594 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 596 aa  555  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 591 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 596 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 594 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 593 aa  554  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 586 aa  551  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 593 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 592 aa  551  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 591 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 602 aa  548  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 592 aa  551  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 596 aa  551  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 592 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 602 aa  547  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 599 aa  545  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 597 aa  545  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 599 aa  541  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 627 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 606 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 588 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 594 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 589 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 617 aa  543  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2262  aspartyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 596 aa  542  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.410754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 598 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 583 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 591 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 614 aa  539  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 583 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 586 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 594 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 603 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 593 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 601 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 584 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 626 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 619 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 594 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 598 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 599 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 590 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2114  aspartyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 601 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454587  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 590 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 596 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2160  aspartyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 601 aa  537  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 590 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>