More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2086 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 		 590 aa  756    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 607 aa  776    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  62.18 
 
 		 592 aa  756    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  73.46 
 
 		 585 aa  880    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  62.14 
 
 		 600 aa  755    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  55.84 
 
 		 598 aa  684    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 		 609 aa  760    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 579 aa  1180    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 		 1019 aa  741    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  75.69 
 
 		 584 aa  904    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  67.52 
 
 		 590 aa  825    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  74.96 
 
 		 578 aa  917    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  63.54 
 
 		 590 aa  764    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  65.45 
 
 		 591 aa  779    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  63.84 
 
 		 591 aa  759    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  82.12 
 
 		 584 aa  984    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  65.7 
 
 		 592 aa  801    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  65.42 
 
 		 598 aa  778    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 		 601 aa  742    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  63.44 
 
 		 600 aa  768    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 586 aa  845    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  63.46 
 
 		 572 aa  735    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 599 aa  688    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  63.14 
 
 		 599 aa  777    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  65.2 
 
 		 599 aa  791    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  61.68 
 
 		 604 aa  760    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 590 aa  744    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 596 aa  760    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  62.97 
 
 		 596 aa  771    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 		 601 aa  755    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  63.48 
 
 		 610 aa  787    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  65.3 
 
 		 604 aa  781    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  68.38 
 
 		 592 aa  809    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  64.05 
 
 		 590 aa  762    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 		 590 aa  757    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 		 601 aa  754    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 594 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 594 aa  588  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 590 aa  586  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 592 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 627 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 617 aa  585  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 600 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 592 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 601 aa  579  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 601 aa  579  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 591 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 591 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 598 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 591 aa  581  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 590 aa  579  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01837  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 599 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 599 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 597 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 591 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01825  hypothetical protein  50.7 
 
 		 590 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.765739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 586 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 614 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2160  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 601 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 590 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1815  aspartyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 598 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 596 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2262  aspartyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 596 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.410754  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003926  aspartyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 592 aa  575  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 610 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 596 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 586 aa  568  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 596 aa  569  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 593 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 594 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 606 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 590 aa  569  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 593 aa  569  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 592 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 592 aa  568  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 592 aa  571  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 591 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 590 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 597 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 599 aa  570  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 591 aa  571  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 591 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 591 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 591 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 596 aa  567  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 594 aa  568  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 608 aa  565  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>