More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2347 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  59.5 
 
 
599 aa  723    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  62.93 
 
 
584 aa  743    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  75.59 
 
 
598 aa  896    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  69.73 
 
 
604 aa  847    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  80.03 
 
 
601 aa  973    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  72.25 
 
 
591 aa  848    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 
579 aa  756    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  82.88 
 
 
596 aa  1000    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 
585 aa  778    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 
584 aa  783    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  64.88 
 
 
604 aa  759    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  86.76 
 
 
590 aa  1055    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  72.91 
 
 
590 aa  885    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  71.84 
 
 
590 aa  828    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  72.97 
 
 
592 aa  870    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
590 aa  1195    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  71.74 
 
 
599 aa  866    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  59.33 
 
 
598 aa  720    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  99.65 
 
 
572 aa  1154    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  63.9 
 
 
591 aa  773    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  72.93 
 
 
600 aa  851    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  64.01 
 
 
586 aa  765    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  74.83 
 
 
592 aa  898    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  81.2 
 
 
600 aa  983    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  73.76 
 
 
609 aa  879    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  68.7 
 
 
578 aa  816    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  73.11 
 
 
610 aa  884    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  70.92 
 
 
596 aa  847    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  70.62 
 
 
601 aa  827    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  65.55 
 
 
607 aa  765    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  63.19 
 
 
1019 aa  738    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  66.55 
 
 
592 aa  784    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  75.08 
 
 
590 aa  890    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  99.83 
 
 
590 aa  1192    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  86.54 
 
 
601 aa  1052    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  70.75 
 
 
599 aa  846    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
590 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
594 aa  570  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
597 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
598 aa  568  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
594 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
596 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
600 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
594 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
592 aa  559  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
592 aa  559  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
601 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
591 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
591 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
594 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 
596 aa  552  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
602 aa  553  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
627 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
591 aa  551  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
589 aa  550  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
588 aa  551  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
591 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
591 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
596 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
592 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
593 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
594 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
593 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
591 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
591 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
598 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
586 aa  543  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
591 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
606 aa  545  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
602 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
592 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
586 aa  541  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
596 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
603 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
599 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
593 aa  538  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2262  aspartyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
596 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.410754  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
596 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
594 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
594 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
592 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4178  aspartyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
589 aa  539  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
593 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
591 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
597 aa  537  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2114  aspartyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
601 aa  538  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
598 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
594 aa  535  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
599 aa  535  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
598 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
619 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
583 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
584 aa  537  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
589 aa  537  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
608 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1981  aspartyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
585 aa  535  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000379313  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
583 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
595 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
583 aa  534  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>