More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1963 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  73.49 
 
 		 601 aa  872    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  66.16 
 
 		 585 aa  785    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  73.13 
 
 		 600 aa  880    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  72.56 
 
 		 592 aa  874    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  73.83 
 
 		 591 aa  888    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 584 aa  788    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  68.12 
 
 		 607 aa  800    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  76.25 
 
 		 598 aa  916    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 		 586 aa  791    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  75.17 
 
 		 599 aa  894    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 		 591 aa  778    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  72.68 
 
 		 599 aa  877    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 		 579 aa  755    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  80.03 
 
 		 590 aa  973    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  74.83 
 
 		 590 aa  874    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  75.25 
 
 		 592 aa  912    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  82.14 
 
 		 600 aa  1024    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  73.15 
 
 		 604 aa  895    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  65 
 
 		 1019 aa  766    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 601 aa  1219    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  60.4 
 
 		 598 aa  733    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  73.51 
 
 		 610 aa  918    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  67.63 
 
 		 578 aa  814    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  80.11 
 
 		 572 aa  947    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 		 584 aa  740    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 		 590 aa  889    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  76.74 
 
 		 596 aa  937    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  73.76 
 
 		 609 aa  894    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 599 aa  736    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  67.45 
 
 		 604 aa  796    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  73.17 
 
 		 596 aa  883    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  79.15 
 
 		 590 aa  964    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  63.61 
 
 		 592 aa  763    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  72.13 
 
 		 590 aa  878    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  79.86 
 
 		 590 aa  971    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  79.35 
 
 		 601 aa  964    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 590 aa  595  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 594 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 597 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 627 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 606 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 600 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 594 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 591 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 602 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 594 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 594 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 586 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 591 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 599 aa  568  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 596 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 592 aa  571  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  50.66 
 
 		 591 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 596 aa  568  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 610 aa  568  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 591 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 598 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 596 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 596 aa  566  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 598 aa  566  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 592 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 591 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 596 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 599 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 592 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 598 aa  560  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 593 aa  561  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 593 aa  561  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 602 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 594 aa  558  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 		 601 aa  557  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 590 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 608 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 589 aa  558  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 585 aa  558  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 591 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 584 aa  556  1e-157  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 592 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 614 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4178  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 589 aa  554  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 619 aa  552  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 597 aa  550  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 599 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 600 aa  551  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 601 aa  546  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 583 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 594 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 603 aa  548  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 583 aa  547  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 594 aa  547  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 588 aa  548  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 618 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 602 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 617 aa  543  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>