More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2366 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 586 aa  1191    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  64.01 
 
 		 590 aa  765    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  69.48 
 
 		 584 aa  823    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  67.06 
 
 		 599 aa  803    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  63.67 
 
 		 600 aa  765    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  67.4 
 
 		 599 aa  803    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  63.44 
 
 		 600 aa  753    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 579 aa  845    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  65.26 
 
 		 592 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 		 610 aa  806    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 		 601 aa  791    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 590 aa  796    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  70.58 
 
 		 607 aa  837    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 604 aa  785    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  72.93 
 
 		 578 aa  871    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  71.68 
 
 		 585 aa  847    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 596 aa  752    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  59.63 
 
 		 598 aa  716    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 1019 aa  795    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  64.1 
 
 		 572 aa  742    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 609 aa  759    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 592 aa  760    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  68.47 
 
 		 598 aa  813    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  65.2 
 
 		 590 aa  777    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  70.86 
 
 		 584 aa  857    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 		 591 aa  796    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  70.48 
 
 		 604 aa  841    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  65.54 
 
 		 596 aa  788    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 		 591 aa  777    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 592 aa  789    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  66.89 
 
 		 590 aa  790    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  64.01 
 
 		 590 aa  765    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 599 aa  721    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  63.67 
 
 		 601 aa  765    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 590 aa  762    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 601 aa  766    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 592 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 597 aa  608  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 590 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 594 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 600 aa  601  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 600 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 592 aa  594  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 599 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 586 aa  594  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 617 aa  592  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 594 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 599 aa  586  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 599 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 592 aa  588  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 596 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 596 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 592 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 596 aa  579  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 585 aa  579  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 601 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 591 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 591 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 591 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 601 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 597 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 591 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 599 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 627 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 591 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 591 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 601 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 594 aa  574  1.0000000000000001e-162  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 594 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 602 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 591 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 591 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 591 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 591 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 591 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 600 aa  570  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 606 aa  571  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 591 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 588 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 593 aa  568  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 591 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 600 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 597 aa  571  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 591 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 591 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 598 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 599 aa  571  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 595 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 591 aa  568  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 599 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 594 aa  566  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 608 aa  565  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 591 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 601 aa  566  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 610 aa  568  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 591 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>