More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0420 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20670  aspartyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 593 aa  655    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04440  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 592 aa  659    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.462018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0420  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 608 aa  1254    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 592 aa  698    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 600 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 590 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 591 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 591 aa  601  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 591 aa  601  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 591 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 589 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 591 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 591 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 592 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 594 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 590 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 600 aa  588  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 598 aa  586  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 594 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 593 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 594 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 593 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 597 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 596 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 602 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 627 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 585 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 592 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 594 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 593 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 586 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 606 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 595 aa  571  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 593 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 598 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 613 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 614 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 588 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 583 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 601 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 587 aa  559  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 598 aa  559  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 583 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 602 aa  555  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 597 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 597 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 597 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 583 aa  555  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 610 aa  555  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 587 aa  553  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 583 aa  554  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 619 aa  552  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 582 aa  552  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 596 aa  552  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 578 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 583 aa  554  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 603 aa  551  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 594 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 598 aa  546  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 594 aa  548  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 589 aa  547  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 604 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 584 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 599 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 610 aa  539  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 595 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 588 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 590 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 588 aa  539  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01552  aspartyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 588 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 599 aa  537  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 599 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 599 aa  537  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 598 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 617 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 594 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 583 aa  538  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 598 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 599 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 600 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 579 aa  535  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 597 aa  535  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 583 aa  535  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 581 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 600 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 592 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 591 aa  533  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 617 aa  533  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 595 aa  533  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 618 aa  532  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>