More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0692 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5926  aspartyl-tRNA synthetase  82.28 
 
 		 619 aa  960    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740175  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0692  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 620 aa  1241    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0534  aspartyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 588 aa  615  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 592 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 594 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 594 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 603 aa  552  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 590 aa  554  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 593 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 579 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 602 aa  548  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 585 aa  549  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 609 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 594 aa  548  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 586 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 586 aa  547  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 627 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 588 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 584 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 594 aa  544  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 590 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 598 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 601 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 589 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 600 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 590 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 594 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 600 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 584 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 593 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 578 aa  538  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 594 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 600 aa  538  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 596 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 589 aa  537  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 597 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 597 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 594 aa  538  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 607 aa  532  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 608 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 589 aa  534  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 596 aa  532  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 604 aa  534  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 597 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 604 aa  530  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 595 aa  531  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 610 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 591 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 591 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 614 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 591 aa  528  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 591 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 591 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 591 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 591 aa  528  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 589 aa  528  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 598 aa  527  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 591 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 593 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 591 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 597 aa  528  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 599 aa  525  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 598 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 592 aa  522  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 599 aa  522  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 594 aa  524  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 601 aa  525  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 595 aa  524  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 592 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2047  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 580 aa  520  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0219169  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 591 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 617 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 591 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 591 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 596 aa  521  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 592 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 592 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 592 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 585 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 606 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 600 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 600 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 598 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 590 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 592 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 597 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 590 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 599 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 599 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  47.04 
 
 		 598 aa  513  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04440  aspartyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 592 aa  512  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.462018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 619 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 607 aa  512  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 595 aa  513  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 601 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 587 aa  509  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0420  aspartyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 608 aa  510  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 592 aa  509  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 594 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>