More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2475 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
597 aa  698    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
595 aa  1228    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
590 aa  632  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 
595 aa  627  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
586 aa  627  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
600 aa  625  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
602 aa  623  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
592 aa  616  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
594 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
594 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
590 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
597 aa  610  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
592 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
594 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
596 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
594 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
593 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
610 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
608 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
594 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
593 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
614 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
598 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
627 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
603 aa  595  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
593 aa  595  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
589 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
619 aa  596  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
585 aa  596  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
597 aa  598  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 
594 aa  595  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
613 aa  592  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
591 aa  590  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
593 aa  591  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
591 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
606 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
591 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
591 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
591 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
591 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
591 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
601 aa  586  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
591 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
591 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
592 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
597 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
602 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
598 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
597 aa  581  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
602 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
599 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
597 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
599 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
600 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
602 aa  571  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 
623 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
595 aa  570  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
600 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
601 aa  568  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
600 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
623 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
599 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
600 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0582  aspartyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
599 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
601 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
599 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
597 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
600 aa  568  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
600 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
600 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
600 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
600 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
605 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
599 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
598 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 
589 aa  562  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
599 aa  561  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
600 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
594 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
586 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
598 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
599 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
600 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
592 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
607 aa  561  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
600 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
600 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
600 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
604 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
605 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
592 aa  557  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
588 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
611 aa  557  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
596 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>