More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_21621 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_18201  aspartyl-tRNA synthetase  73.34 
 
 		 606 aa  950    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18791  aspartyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 598 aa  779    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.77028  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1290  aspartyl-tRNA synthetase  99.51 
 
 		 612 aa  1256    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  62.19 
 
 		 614 aa  796    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2233  aspartyl-tRNA synthetase  71.07 
 
 		 610 aa  911    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18791  aspartyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 602 aa  806    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2595  aspartyl-tRNA synthetase  70.96 
 
 		 609 aa  939    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.325867 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1781  aspartyl-tRNA synthetase  62.23 
 
 		 598 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 599 aa  818    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18981  aspartyl-tRNA synthetase  63.23 
 
 		 598 aa  799    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  62.96 
 
 		 597 aa  808    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 		 598 aa  768    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29551  aspartyl-tRNA synthetase  73.6 
 
 		 606 aa  959    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  61.4 
 
 		 595 aa  785    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  60.86 
 
 		 618 aa  790    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 		 626 aa  767    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21621  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 612 aa  1259    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.403344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  60.03 
 
 		 595 aa  767    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 594 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16561  predicted protein  51.07 
 
 		 623 aa  606  9.999999999999999e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0953344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 600 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 594 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 589 aa  598  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 588 aa  598  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 591 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 608 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 591 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 602 aa  594  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 591 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 591 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 591 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 591 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 599 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 599 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 596 aa  588  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 591 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 591 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 591 aa  591  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 585 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 590 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 617 aa  586  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 595 aa  585  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 627 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 592 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 		 597 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 590 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 591 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 596 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 600 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 596 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 586 aa  578  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 619 aa  579  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 588 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 593 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 593 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 606 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 594 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 593 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 588 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 594 aa  571  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 596 aa  568  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 592 aa  571  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 599 aa  568  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 588 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 593 aa  571  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 597 aa  571  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 594 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 600 aa  565  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 600 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 592 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 611 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 600 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 600 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 592 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 600 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 600 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 605 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 599 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 598 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 599 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 596 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 601 aa  565  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 599 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 598 aa  560  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 600 aa  561  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 592 aa  560  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 599 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 583 aa  556  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 601 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 600 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 600 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 604 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 601 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>