More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1781 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_18791  aspartyl-tRNA synthetase  95.48 
 
 
598 aa  1143    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.77028  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 
598 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 
618 aa  685    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1290  aspartyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 
612 aa  791    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 
614 aa  700    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2233  aspartyl-tRNA synthetase  61.06 
 
 
610 aa  764    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2595  aspartyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 
609 aa  785    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.325867 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1781  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
598 aa  1215    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 
599 aa  718    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18201  aspartyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 
606 aa  762    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18791  aspartyl-tRNA synthetase  85.05 
 
 
602 aa  1068    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29551  aspartyl-tRNA synthetase  62.23 
 
 
606 aa  788    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
595 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
626 aa  695    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 
597 aa  703    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21621  aspartyl-tRNA synthetase  62.23 
 
 
612 aa  790    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.403344 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18981  aspartyl-tRNA synthetase  95.82 
 
 
598 aa  1175    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 
595 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
591 aa  609  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
591 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
591 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
591 aa  609  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
591 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
591 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
591 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
591 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
591 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
589 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
591 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
592 aa  599  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
590 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 
602 aa  592  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
594 aa  590  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
594 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
619 aa  586  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
627 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
597 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
606 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
608 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
588 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
594 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
599 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
585 aa  575  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
596 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
590 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
586 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
596 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
588 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
588 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
595 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
598 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
597 aa  571  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
597 aa  567  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
592 aa  568  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
593 aa  568  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16561  predicted protein  47.83 
 
 
623 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0953344  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
588 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
599 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
610 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01837  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
590 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
590 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
590 aa  560  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01825  hypothetical protein  47.25 
 
 
590 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.765739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
594 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
611 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
601 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
596 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
590 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
599 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
599 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
593 aa  555  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
593 aa  558  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
593 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
593 aa  555  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
596 aa  555  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
590 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
594 aa  557  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
592 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
590 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
593 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
590 aa  558  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
590 aa  558  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
590 aa  558  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
597 aa  557  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
614 aa  555  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
599 aa  554  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
591 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
598 aa  555  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
592 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
598 aa  555  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
591 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
599 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
591 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
617 aa  555  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
598 aa  555  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
583 aa  554  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
592 aa  555  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>