102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3740 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  457  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  61.67 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  61.25 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  62.95 
 
 		 226 aa  280  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  61.29 
 
 		 217 aa  267  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  60.83 
 
 		 217 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  57.14 
 
 		 246 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  59.45 
 
 		 215 aa  260  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  56.67 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  53.69 
 
 		 241 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  56.46 
 
 		 210 aa  241  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  54.47 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  53.08 
 
 		 244 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  52.09 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  49.56 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  51.35 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  50.92 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  49.08 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  49.55 
 
 		 219 aa  191  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  47.3 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  41.8 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  46.39 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  53.85 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  39.38 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  39.3 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  52.1 
 
 		 151 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  35.91 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  31.1 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  56.92 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  32.8 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  28.95 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  45.83 
 
 		 177 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  27.51 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  31.95 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  32.93 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  27.71 
 
 		 346 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  28.04 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  28.42 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  64.1 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  28.37 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  30.23 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  26.61 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  28.43 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  28.65 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  27.07 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  27.65 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  29.47 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  30.52 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  26.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  28.37 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  30.06 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  27.36 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  26.89 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  26.34 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  27.09 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  28.72 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  31.79 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  25.71 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  28.64 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  25.66 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  28.65 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  32.22 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  28.65 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  25.4 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  25.11 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  23.89 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  26.03 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  27.11 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  26.91 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  27.61 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  24.36 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  24.82 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  26.55 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  26.75 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1580  hypothetical protein  30.39 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  26.03 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  26.03 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  25.55 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  25.93 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  26.98 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  35.34 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  26.17 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  28.74 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  27.61 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  25.23 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  28.85 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  25.57 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41280  hypothetical protein  30.7 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4716  hypothetical protein  31.43 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1998  hypothetical protein  45.24 
 
 		 77 aa  41.6  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  29.17 
 
 		 252 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>