137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4176 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  77.67 
 
 
222 aa  346  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  75.93 
 
 
215 aa  328  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  74.65 
 
 
215 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  74.07 
 
 
214 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  57.39 
 
 
230 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  77.71 
 
 
232 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  62.19 
 
 
244 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  55 
 
 
215 aa  215  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  46.56 
 
 
246 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  55.41 
 
 
217 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  46.59 
 
 
244 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  50.93 
 
 
210 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  52.68 
 
 
220 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  54.5 
 
 
217 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  46.09 
 
 
241 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  44.44 
 
 
241 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  45.78 
 
 
244 aa  201  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  50.65 
 
 
226 aa  201  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  49.29 
 
 
229 aa  194  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  49.55 
 
 
222 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  43.8 
 
 
256 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  41.7 
 
 
219 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  37.36 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  42.45 
 
 
208 aa  141  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  48.73 
 
 
208 aa  134  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  40.62 
 
 
223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  31.88 
 
 
216 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  38.26 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  31.65 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  30.52 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  29.28 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  29.41 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  29.03 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  29.07 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  30.19 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  32.92 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  55.22 
 
 
74 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  28.31 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  31.43 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  27.36 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  27.36 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  30.84 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  72.09 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  28.04 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  27.54 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  28.5 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  27 
 
 
255 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  27.36 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  28.35 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.17 
 
 
233 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  26.84 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  28.11 
 
 
224 aa  62  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  30 
 
 
226 aa  62  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  29.87 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  29.38 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  29.44 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  28.5 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  26.76 
 
 
224 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  28.04 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  25.41 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  31.28 
 
 
240 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  31.3 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  28.92 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30.16 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  29.63 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  29.28 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  25.89 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  26.89 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  30.24 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  25.65 
 
 
247 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  26.46 
 
 
235 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  29.73 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  25.98 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  28.19 
 
 
250 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  27.01 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  30.99 
 
 
233 aa  55.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  25.94 
 
 
197 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  25.71 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  27.49 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  27.49 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  26.76 
 
 
257 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  46.38 
 
 
177 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  26.76 
 
 
259 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  35.59 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  28.32 
 
 
247 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  26.26 
 
 
259 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  28.36 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  29.03 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  28.34 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  26.04 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  28.84 
 
 
243 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  32.33 
 
 
165 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  29.14 
 
 
220 aa  52  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  27.51 
 
 
223 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  26.07 
 
 
221 aa  52  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  31.41 
 
 
252 aa  51.6  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  23.41 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  29.27 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>