94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0544 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 215 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  83.8 
 
 		 217 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  83.8 
 
 		 217 aa  371  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  63.14 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  59.32 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  59.49 
 
 		 241 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  57.92 
 
 		 244 aa  262  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  59.45 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  60.29 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  55.83 
 
 		 244 aa  250  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  58.22 
 
 		 226 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  54.7 
 
 		 230 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  55 
 
 		 219 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  53.21 
 
 		 215 aa  214  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  52.75 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  52.29 
 
 		 215 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  53.3 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  50.45 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  51.58 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  47.44 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  42.5 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  40.87 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  48.19 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  53.47 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  40.38 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  42.11 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  40.91 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  42.5 
 
 		 151 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  67.16 
 
 		 74 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  87.5 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  70.37 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  27.75 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  62.79 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  29.67 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  27.98 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  27.66 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  31.09 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31.32 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  30.73 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  30.41 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  28.05 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  27.5 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  29.79 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  27.13 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  24.19 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  28.7 
 
 		 346 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  32.11 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  28.83 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  28.04 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  30.37 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  27.21 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  28.14 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  29.19 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  26.79 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  34.45 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  26.06 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  27.21 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  27.5 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  31.3 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  31.77 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  28.5 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  27.36 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  27.57 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  25.59 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  25.59 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  28.44 
 
 		 261 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  29.83 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  29.77 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  25.59 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  24.47 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  29.84 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  29.85 
 
 		 252 aa  45.1  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  30.37 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  25.93 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  29.82 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  25.88 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  25.13 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  27.41 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  29.69 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  27.23 
 
 		 317 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  27.85 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1998  hypothetical protein  47.37 
 
 		 77 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  25.38 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  28.84 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  31.38 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  25.14 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  27.8 
 
 		 247 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  25.81 
 
 		 220 aa  42  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  33.6 
 
 		 168 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  29.46 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  28.99 
 
 		 240 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  29.91 
 
 		 255 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>