118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3432 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  90.16 
 
 		 244 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  72.5 
 
 		 241 aa  362  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  69.58 
 
 		 241 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  67.21 
 
 		 246 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  61.67 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  60.48 
 
 		 226 aa  274  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  58.26 
 
 		 217 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  57.92 
 
 		 215 aa  262  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  57.44 
 
 		 217 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  47.47 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  50.21 
 
 		 210 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  50.77 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  52.32 
 
 		 244 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  48.36 
 
 		 215 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  48.77 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  48.36 
 
 		 215 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  46.59 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  78.15 
 
 		 151 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  45.9 
 
 		 214 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  47.98 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  43.75 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  40.07 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  46.28 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  50.89 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  37.5 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  36 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  35.71 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  69.23 
 
 		 74 aa  88.6  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  27.54 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  67.92 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30.09 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  29.03 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  79.49 
 
 		 98 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  33.49 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  28.35 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  31.78 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  30.13 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  28.35 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  31.63 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  27.49 
 
 		 227 aa  62  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  26.94 
 
 		 235 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  27.92 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  28.17 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.02 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  28.79 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  60.87 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  24.59 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  29.32 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  26.83 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  30.61 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  29.44 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  26.25 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  27.89 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  24.89 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  28.63 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  29.02 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  27.14 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  29.17 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  28.1 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  29.32 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  25.23 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  26.02 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  30.73 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  27.57 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  26.42 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  25.21 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  24.06 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  27.16 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  29.11 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  27.92 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  23.24 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  25.32 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  25.94 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  25.47 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  33.01 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  24.26 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  26.76 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1998  hypothetical protein  60 
 
 		 77 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  26.54 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  27.14 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  27.35 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  26.81 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  33.1 
 
 		 165 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  27.46 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  24.77 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  23.79 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  24.05 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  31.67 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  26.24 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  26.27 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  25.82 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  33.87 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  26.27 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  29.09 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  26.98 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  26.29 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  29.31 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  29.2 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>