30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0018 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  76.81 
 
 
230 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  76.06 
 
 
220 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  67.16 
 
 
215 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  65.67 
 
 
241 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  66.15 
 
 
217 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  64.62 
 
 
217 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  67.69 
 
 
244 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  69.23 
 
 
244 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  64.06 
 
 
244 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  60.94 
 
 
257 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  53.42 
 
 
229 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  59.7 
 
 
246 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  56.92 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  64.62 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  53.42 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  54.55 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  59.38 
 
 
226 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  53.03 
 
 
232 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  52.17 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  53.03 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  50.72 
 
 
214 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  82.05 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  55.22 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  54 
 
 
208 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  50.88 
 
 
210 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  47.69 
 
 
177 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  50 
 
 
219 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  43.4 
 
 
208 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  35.94 
 
 
223 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>