157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3296 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  69.23 
 
 		 230 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  60.19 
 
 		 215 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  61.27 
 
 		 215 aa  244  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  62.19 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  60.49 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  58.13 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  58.57 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  53.02 
 
 		 229 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  52.32 
 
 		 244 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  50.64 
 
 		 241 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  51.06 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  53.08 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  53.3 
 
 		 215 aa  208  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  47.39 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  54.46 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  53.52 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  51.6 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  46.81 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  45.99 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  62.07 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  39.68 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  48.52 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  42.31 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  38.22 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  41.1 
 
 		 223 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  64.06 
 
 		 74 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  38.75 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  42.02 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  35.43 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  29.11 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  33.97 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  32.82 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  32.53 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  37.38 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  33.87 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  28.86 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  32.84 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  31.87 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  28.28 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  31.84 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  32.97 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  30.19 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  30.91 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  34.5 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  32.04 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  31.89 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  27.27 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  31.14 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  38.41 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  29.01 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  29.21 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  35.24 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  34.39 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  29.44 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  31.76 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  31.02 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  30.34 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  28.25 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  70 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  31.82 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.16 
 
 		 227 aa  62  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  30.83 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  29.73 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  28.95 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  58.49 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  30.86 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  35.8 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  32.52 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  30.84 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  29.33 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  31.64 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  27.13 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  30.22 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  29.72 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  35.4 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  29.91 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  28.74 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  29.67 
 
 		 346 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  34.17 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  28.37 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  29.41 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  32.39 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  30.95 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  31.82 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  29.94 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  33.61 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  30.68 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  24.72 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  36.47 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  26.22 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  27.94 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  30.87 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  30.23 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  31.31 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  31.16 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  26.98 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>