111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3320 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  90.16 
 
 		 244 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  72.38 
 
 		 241 aa  357  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  66.95 
 
 		 241 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  66.11 
 
 		 246 aa  324  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  61.25 
 
 		 222 aa  281  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  59.11 
 
 		 226 aa  264  8.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  56.43 
 
 		 217 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  55.83 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  55.6 
 
 		 217 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  50.96 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  49.79 
 
 		 210 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  45.7 
 
 		 257 aa  218  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  51.06 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  47.13 
 
 		 215 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  46.72 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  48.4 
 
 		 220 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  47.54 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  45.78 
 
 		 219 aa  201  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  77.31 
 
 		 151 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  45.45 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  43.33 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  39.33 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  44.44 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  54.67 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  38.89 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  36.8 
 
 		 219 aa  122  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  34.29 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  67.69 
 
 		 74 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  27.97 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  57.58 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  79.49 
 
 		 98 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  28.69 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  35.9 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  28.97 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  31.58 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  27.57 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  27.31 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  28.46 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  29.93 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  25.55 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  25.91 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  31.58 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  36.7 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  25.37 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  23.65 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  22.82 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  34.17 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  58.7 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  30.66 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  27.32 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  27.09 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  24.05 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  26.47 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  35.9 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1998  hypothetical protein  64.44 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  27.2 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  28.46 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  27.31 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  24.8 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  29.58 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  23.48 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  32.79 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  24.05 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  26.25 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  28.7 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  32.82 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  26.46 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  27.44 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  28.43 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  23.53 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  24.06 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  28.18 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  24.88 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  33.85 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  34.71 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  26.38 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  26.25 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  24.62 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  23.5 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  28.38 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  26.64 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  30.17 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  23.45 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  26.79 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  23.85 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  25 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  30.97 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  31.93 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  35.87 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  32.73 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  30.09 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  26.61 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  28.49 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  24.53 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  23.04 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  24.79 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  24.62 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>