195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2333 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  44.59 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  39.37 
 
 		 215 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  41.06 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  40.31 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  38.74 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  38.22 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  35.19 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  29.41 
 
 		 207 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  32.11 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  38.97 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  37.87 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  34.9 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  35.26 
 
 		 228 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  34.41 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  34.86 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  36.71 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  37.13 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  37.72 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  36.62 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  36.93 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  37.28 
 
 		 221 aa  92.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  33.81 
 
 		 221 aa  92.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  35.08 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  32.94 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  35.6 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  30.65 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  29.29 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  34.72 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  30.34 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  31.43 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  32.99 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  35.18 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  36.91 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  34.32 
 
 		 222 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  31.28 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  35.2 
 
 		 179 aa  85.9  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  27.33 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  35.54 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  32.57 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.53 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  25.95 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  31.62 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30.81 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  32.56 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  31.48 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  31.91 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  34.95 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  32.38 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  27.44 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  35.9 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  34.62 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  33.55 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  30.95 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  33.53 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  30.52 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  33.12 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  33.12 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  37.2 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  32.32 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  33.11 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  32.67 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  31.82 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  34.02 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  36.31 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  32.48 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  30.11 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  30.23 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  29.21 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  28.25 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  31.18 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  31.18 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  30.81 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  32.62 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  31.03 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  31.18 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  31.72 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  32.1 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  30.18 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  33.76 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  33.52 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  33.12 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  29.65 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  31.49 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  32.78 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  30.83 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  33.77 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  28.96 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  30.11 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  30.54 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  30.43 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  31.28 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  32.52 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  30.13 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  32.26 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>