214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07175 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  532  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  36.6 
 
 
247 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  36.96 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  33.67 
 
 
222 aa  128  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  34.2 
 
 
233 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  38.79 
 
 
233 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  37.57 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  37.57 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  38.79 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  34.36 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  34.34 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  37.02 
 
 
222 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  35.29 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  36.46 
 
 
222 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  35.71 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  35.48 
 
 
226 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  33.51 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  31.33 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  38.1 
 
 
222 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  33.66 
 
 
226 aa  111  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  37.18 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  39.02 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  36.59 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  37.8 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  34.09 
 
 
219 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  36.47 
 
 
236 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  37.04 
 
 
253 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  35.76 
 
 
221 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.69 
 
 
232 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  35.53 
 
 
221 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  37.74 
 
 
255 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  34.1 
 
 
221 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  36.09 
 
 
227 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  36.36 
 
 
243 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  34.81 
 
 
235 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  36.09 
 
 
261 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  37.74 
 
 
243 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  35.98 
 
 
259 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  34.34 
 
 
238 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  37.34 
 
 
254 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  32.22 
 
 
212 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  32.22 
 
 
212 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  37.36 
 
 
338 aa  101  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  36.21 
 
 
227 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  39.39 
 
 
224 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  34.57 
 
 
254 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  37.18 
 
 
268 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  36.65 
 
 
255 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  30.41 
 
 
290 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  33.68 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  37.11 
 
 
252 aa  99  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  34.16 
 
 
218 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  30.29 
 
 
237 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  32.5 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  34.34 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  96.3  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  34.15 
 
 
257 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.83 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  31.63 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  35.57 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  36.84 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  32.08 
 
 
215 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  30.53 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  35.53 
 
 
218 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  32.94 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  36.62 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  37.96 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.03 
 
 
242 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  29.82 
 
 
247 aa  89  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  30.6 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  30 
 
 
231 aa  89  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  35.9 
 
 
252 aa  88.6  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  31.94 
 
 
254 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  30.48 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  31.94 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  29.56 
 
 
250 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  32.12 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  36.88 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  41.28 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  33.13 
 
 
214 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  30.22 
 
 
225 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  34.48 
 
 
337 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  34.84 
 
 
266 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  30.15 
 
 
248 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  34.84 
 
 
266 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  34.19 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  34.31 
 
 
231 aa  85.5  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  28.8 
 
 
240 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  31.64 
 
 
234 aa  85.1  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  37.11 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  27.91 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  28.8 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  34.22 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  36.84 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  32.93 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  29 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  28.86 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  33.81 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  39.39 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>