29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1929 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1929  gp33  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  80.66 
 
 
233 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  61.98 
 
 
238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  58.33 
 
 
234 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  53.3 
 
 
225 aa  201  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  52.2 
 
 
260 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  50.28 
 
 
225 aa  191  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  37.1 
 
 
228 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  32.04 
 
 
227 aa  98.2  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  42.71 
 
 
265 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4717  protein of unknown function DUF159  34.75 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.143313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  31.02 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  32.12 
 
 
237 aa  82  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  34.29 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  33 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  29.51 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  30.97 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  39.18 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  32.26 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  66.67 
 
 
84 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  29.29 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  31.78 
 
 
238 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  29.25 
 
 
245 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  29.63 
 
 
240 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  32.14 
 
 
252 aa  44.7  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  35.63 
 
 
259 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  25.99 
 
 
241 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  29.17 
 
 
227 aa  41.2  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  26.55 
 
 
221 aa  41.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>