24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1498 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  88.31 
 
 
233 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1281  gp33  92.19 
 
 
64 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  71.43 
 
 
238 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  71.79 
 
 
234 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1045  hypothetical protein  78.85 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024831  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  52.56 
 
 
260 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  51.28 
 
 
225 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  50.65 
 
 
225 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  51.56 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  41.56 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  55.74 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  48.33 
 
 
265 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  40.28 
 
 
215 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  54.55 
 
 
179 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1766  hypothetical protein  72.22 
 
 
73 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2378  hypothetical protein  72.22 
 
 
73 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  41.27 
 
 
207 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  66.67 
 
 
189 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  37.5 
 
 
214 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  39.71 
 
 
232 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  34.72 
 
 
246 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  40.28 
 
 
224 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>