108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4665 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  88.76 
 
 		 179 aa  315  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  48.94 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  49.33 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  41.85 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  37.06 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  34.98 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  34.38 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  37.58 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  37.65 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  33.67 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  32 
 
 		 233 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  34.63 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  30.74 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  32.04 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  35.12 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  33.69 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  31.68 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  30.13 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  32.26 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  29.51 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  30.1 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  33.77 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  35.09 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  31.17 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  29.36 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  30.94 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.13 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  31.82 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  28.99 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  32.85 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  27.81 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  28.51 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  29.9 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  32.32 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  27.32 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  35.34 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  27.8 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  27.88 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  33.91 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  30.6 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  29.72 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  27.18 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  31.43 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  28.99 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  24.54 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  30.46 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  27.74 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1281  gp33  41.67 
 
 		 64 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  27.19 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  26.42 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  30.56 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  28.9 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  30.34 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  29.96 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  39.71 
 
 		 84 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  29.7 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  26.36 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  29.36 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.58 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  24.32 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  27.91 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  32 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  29.25 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  29.5 
 
 		 346 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  30.99 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  29.81 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  30.13 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  31.79 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  31.82 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  26.92 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  38.1 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  30.06 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  33.91 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  30.17 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  29.58 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  30.13 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  32.78 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  28.95 
 
 		 268 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  28.86 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  28.47 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  26.74 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  25.88 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  25.57 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  29.8 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  29.8 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  29.46 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  32.46 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  30.84 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1045  hypothetical protein  36.21 
 
 		 126 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024831  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  28.87 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  33.73 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  28.06 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  30.28 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  31.19 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>