147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2524 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  50 
 
 
346 aa  167  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  45.93 
 
 
201 aa  161  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  33.97 
 
 
215 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  36.76 
 
 
208 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  33.01 
 
 
215 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  35.92 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  37.9 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  31.58 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  31.88 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  31.82 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  31.1 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  31.13 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  30.73 
 
 
229 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  27.54 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  32.04 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  26.97 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  26.09 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  29.81 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  32.26 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  31.54 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  30.09 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  27.97 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  31.08 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  32.6 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  26.57 
 
 
197 aa  72  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  34.31 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  30.66 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  26.69 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  29.33 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  31.49 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30.24 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  30.19 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  25.97 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  29.44 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  28.37 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  26.53 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  29.61 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  29.57 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  28.7 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  32.62 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30.09 
 
 
224 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  32.09 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  28 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  31.54 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  27.95 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  29.19 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  32.4 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  30.05 
 
 
227 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  30.14 
 
 
225 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  34.44 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  31.1 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  33.61 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  29.76 
 
 
221 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  31.74 
 
 
252 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.76 
 
 
233 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  35 
 
 
268 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  28.29 
 
 
248 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  30.99 
 
 
266 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  30.99 
 
 
266 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  29.61 
 
 
222 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  30.12 
 
 
191 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  28.77 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  29.12 
 
 
248 aa  55.1  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  30.88 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  30.77 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  31.49 
 
 
261 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  25.73 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3372  hypothetical protein  29.61 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0200  hypothetical protein  22.64 
 
 
203 aa  52.4  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.189466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  27.72 
 
 
259 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  35.19 
 
 
199 aa  52  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  30.87 
 
 
246 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  32.93 
 
 
252 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  27.55 
 
 
239 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  32.24 
 
 
281 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0386  hypothetical protein  35.16 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782275  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  26.6 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  32.86 
 
 
261 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  29.33 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  27.4 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  26.47 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30.82 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  27.33 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  29.12 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  29.32 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  30.09 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  26.94 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  30 
 
 
252 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  25.74 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  30.99 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  30.61 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  26.94 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  30.27 
 
 
260 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  30.16 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  34.91 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  31.91 
 
 
256 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  30.63 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>