112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2756 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  708    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  50 
 
 
216 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  45.15 
 
 
201 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  35.62 
 
 
223 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  29.48 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  30.8 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  26.76 
 
 
197 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  31.76 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  28.69 
 
 
244 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  31.18 
 
 
239 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  34.51 
 
 
252 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  30.5 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  30.1 
 
 
233 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  29.63 
 
 
224 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  28.16 
 
 
198 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  32.26 
 
 
208 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  29.02 
 
 
229 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  29.3 
 
 
257 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  27.64 
 
 
241 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  28.07 
 
 
215 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  30.18 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  30.18 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  30.11 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  27.71 
 
 
222 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  29.41 
 
 
217 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  24.42 
 
 
210 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  32.59 
 
 
199 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  34.06 
 
 
252 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  33.59 
 
 
233 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  32.93 
 
 
261 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  29.67 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  32.16 
 
 
236 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  29.73 
 
 
197 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  29.81 
 
 
222 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  29.26 
 
 
217 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  29.93 
 
 
221 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  30.94 
 
 
246 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  28.99 
 
 
220 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  27.03 
 
 
206 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  27.57 
 
 
235 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  32.09 
 
 
197 aa  53.5  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  28.71 
 
 
222 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  29.2 
 
 
215 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
224 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  23.25 
 
 
218 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  25.91 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  27.41 
 
 
226 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  26.47 
 
 
223 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  26.63 
 
 
242 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 
232 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  39.13 
 
 
248 aa  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1319  hypothetical protein  31.08 
 
 
221 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.104024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  27.95 
 
 
219 aa  49.3  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  28.26 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  31.22 
 
 
196 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  31.25 
 
 
240 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  26.61 
 
 
234 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04161  DUF159 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13150)  34.55 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0736847  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  34.12 
 
 
222 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  33.12 
 
 
218 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  32.14 
 
 
226 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  24.85 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  28.36 
 
 
236 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  26.92 
 
 
220 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  29.5 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  36.28 
 
 
270 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  29.33 
 
 
222 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  30.71 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  31.75 
 
 
227 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  32.18 
 
 
227 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  26.25 
 
 
231 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  27.22 
 
 
165 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  35.77 
 
 
281 aa  47  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  30.1 
 
 
225 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  29.91 
 
 
248 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  29.22 
 
 
226 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  28.91 
 
 
219 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  31.13 
 
 
259 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  26.67 
 
 
243 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  31.48 
 
 
224 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  25.59 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  30.3 
 
 
261 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  31.43 
 
 
222 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  33.66 
 
 
238 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  28.65 
 
 
196 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  30.51 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  26.09 
 
 
232 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  31.09 
 
 
215 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  29.63 
 
 
248 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  33.64 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  32.17 
 
 
254 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  30.28 
 
 
247 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  27.03 
 
 
237 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  31.25 
 
 
246 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  30.97 
 
 
234 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2541  protein of unknown function DUF159  29.58 
 
 
221 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  27.75 
 
 
221 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  60 
 
 
283 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>