83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3808 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 246 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  85.17 
 
 		 241 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  75.52 
 
 		 241 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  67.21 
 
 		 244 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3320  hypothetical protein  66.11 
 
 		 244 aa  324  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0544  protein of unknown function DUF159  59.32 
 
 		 215 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3740  hypothetical protein  57.14 
 
 		 222 aa  261  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3876  protein of unknown function DUF159  55 
 
 		 217 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  54.03 
 
 		 226 aa  241  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3586  hypothetical protein  54.17 
 
 		 217 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0238  hypothetical protein  51.52 
 
 		 210 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5204  hypothetical protein  45.02 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  46.56 
 
 		 219 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  49.79 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  47.06 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  46.91 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  45.64 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  45.27 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  45.23 
 
 		 214 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  45.12 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  45.99 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  40.65 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3770  hypothetical protein  65.55 
 
 		 151 aa  168  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  50.89 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4793  hypothetical protein  43.33 
 
 		 208 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  35.46 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  34.91 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  34.55 
 
 		 223 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0018  hypothetical protein  59.7 
 
 		 74 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.185366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  26.69 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3492  hypothetical protein  58.46 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.205751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  27.65 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.91 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  25.64 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  28 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  26.92 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  30.94 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  51.85 
 
 		 98 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  28.99 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  27.9 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  32.85 
 
 		 165 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  26.69 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  25.75 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  23.42 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  36.09 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  34.38 
 
 		 222 aa  52  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1998  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  26.29 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  24.7 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  25.22 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  26.36 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  26.87 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  29.2 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  23.5 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  31.25 
 
 		 197 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  23.62 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  32.35 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  23.67 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  28.27 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  26.05 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  26.05 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0838  hypothetical protein  47.73 
 
 		 129 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  26.78 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  32.8 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  22.82 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  24.24 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  29.2 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  23.08 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  37.5 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  24.09 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  32.5 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  27.42 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  23 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  30.22 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  28.1 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  28.8 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  32.5 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  25.33 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  30 
 
 		 199 aa  42  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  42  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  33.61 
 
 		 210 aa  42  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  23.11 
 
 		 234 aa  42  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>