158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3812 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  67.01 
 
 
197 aa  279  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  65.99 
 
 
197 aa  277  9e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  57.79 
 
 
198 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  42.71 
 
 
196 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  41.21 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  41.21 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  34.5 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  37.2 
 
 
168 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  36.08 
 
 
165 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  34.84 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  30.91 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  32.65 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  28.09 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  34.51 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  34.13 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  35.29 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  32.8 
 
 
238 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  27.62 
 
 
217 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  30.15 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  29.76 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  35.48 
 
 
234 aa  61.6  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  37.08 
 
 
226 aa  61.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  29.47 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  32 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  27.22 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  34.68 
 
 
281 aa  59.7  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.97 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  31.76 
 
 
226 aa  58.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  29.77 
 
 
232 aa  58.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  31.36 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2523  hypothetical protein  30.23 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  33.75 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  35.42 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  27.89 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  30.32 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  31.58 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  34.83 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30.77 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  29.63 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  35.56 
 
 
243 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  36.05 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  35.24 
 
 
221 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  32.59 
 
 
346 aa  55.5  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  27.14 
 
 
231 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  35.04 
 
 
274 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  30.66 
 
 
234 aa  55.1  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1551  protein of unknown function DUF159  28.47 
 
 
258 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0992681  normal  0.026854 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  35.35 
 
 
227 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  34.45 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  28.37 
 
 
222 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  28.37 
 
 
222 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  35.83 
 
 
223 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  28.37 
 
 
222 aa  54.7  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  29.66 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  29.61 
 
 
212 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  30.17 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  29.58 
 
 
257 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  29.61 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  30.28 
 
 
242 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  28.36 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  28.16 
 
 
226 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  30.41 
 
 
238 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  31.77 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  25.4 
 
 
268 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  28.71 
 
 
226 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.72 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  31.51 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  34.38 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  31.08 
 
 
262 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  35.19 
 
 
216 aa  52  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  31.4 
 
 
236 aa  52  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  28.48 
 
 
237 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04880  hypothetical protein  26.52 
 
 
220 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  27 
 
 
230 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  29.07 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  30.19 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  29.9 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  32.5 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  27.64 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  35.56 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  27.45 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  30.53 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  30.58 
 
 
253 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0200  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.189466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  30.1 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3432  hypothetical protein  24.05 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  26.6 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  26.47 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  27.78 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  25.41 
 
 
252 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  26.6 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  26.6 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  30.16 
 
 
254 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  29.81 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  28.47 
 
 
233 aa  48.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  32.73 
 
 
259 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>