151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5153 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  85.2 
 
 
196 aa  324  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  77.55 
 
 
196 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  49 
 
 
236 aa  197  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  42.71 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  43 
 
 
198 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  41.71 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  40.2 
 
 
197 aa  136  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  37.06 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  36.84 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  30.81 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  32.03 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  39.32 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  26.39 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  28.04 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  30.05 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  28.63 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  28.44 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  27.75 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  32.39 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  31.97 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  34.21 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  28.23 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  26.79 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0811  hypothetical protein  28.84 
 
 
229 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782351  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  32.5 
 
 
227 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  32.43 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  27.51 
 
 
224 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  33.59 
 
 
338 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  30.15 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  31.78 
 
 
253 aa  61.6  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  33.05 
 
 
227 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  28.88 
 
 
244 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  26.32 
 
 
215 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.64 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  32.73 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  33.91 
 
 
243 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  27.85 
 
 
222 aa  58.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  31.45 
 
 
253 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  27.1 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  27.1 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  27.87 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  33.61 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  29.06 
 
 
261 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  36.3 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  34.65 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  29.41 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  27.09 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  29.31 
 
 
337 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3234  hypothetical protein  29.19 
 
 
190 aa  55.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  27.69 
 
 
281 aa  55.5  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  32.99 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0200  hypothetical protein  28.03 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.189466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  27.78 
 
 
253 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  26.03 
 
 
233 aa  55.1  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  27.48 
 
 
220 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  32.2 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  38.71 
 
 
237 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  31.22 
 
 
346 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  24.02 
 
 
237 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  27.89 
 
 
231 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  27.93 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.25 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  27.93 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4176  protein of unknown function DUF159  28.66 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.829162  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  32.95 
 
 
248 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  26.9 
 
 
248 aa  52  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  32.23 
 
 
234 aa  52  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  26.79 
 
 
248 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1551  protein of unknown function DUF159  29.19 
 
 
258 aa  52  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0992681  normal  0.026854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
226 aa  52  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  32.98 
 
 
222 aa  51.6  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  27.64 
 
 
197 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30.36 
 
 
224 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  33.01 
 
 
274 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  25.51 
 
 
241 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  27.6 
 
 
250 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04161  DUF159 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13150)  26.95 
 
 
388 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0736847  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  32.46 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  28.1 
 
 
253 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  25 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  25.23 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  29.31 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  33.96 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  30.88 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  32.61 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  30.15 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  24.5 
 
 
239 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  26.5 
 
 
226 aa  48.9  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1849  hypothetical protein  22.17 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  25 
 
 
261 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  24.47 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7622  protein of unknown function DUF159  25.97 
 
 
232 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  30.53 
 
 
197 aa  48.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3144  hypothetical protein  27.89 
 
 
256 aa  48.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  30.43 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  27.05 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  29.37 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  25.12 
 
 
252 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>