174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3104 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  48.5 
 
 		 196 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  51.5 
 
 		 196 aa  187  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  49 
 
 		 196 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  34.85 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  33.84 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  34.5 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  33.67 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  36.42 
 
 		 165 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  32 
 
 		 168 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  32.87 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  30.22 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0478  protein of unknown function DUF159  28.81 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  33.86 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  31.96 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.41 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  34.78 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  32.53 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  31.69 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  30.23 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  30.26 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  27.73 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  27.35 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  36.19 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  28.44 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  32.05 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  30.05 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  31.38 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  32.72 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  25.81 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  28.72 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  27.96 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  27.96 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  29.63 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  28.96 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  28.96 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  30.11 
 
 		 281 aa  62  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  28.5 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  29.05 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  29.47 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  28.37 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  25.97 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  34.48 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  29.49 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  31.35 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  27.64 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  34.71 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  28.71 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  27.6 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  31.3 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  34.43 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  28.66 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  30.06 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  29.72 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  26.64 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  26.6 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  27.03 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  29.41 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  32.16 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  28 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  31.47 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  27.07 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  25.93 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  30.95 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  26.18 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  28.5 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  30.34 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  28.83 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1319  hypothetical protein  31.93 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.104024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  26.45 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  29.45 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  29.17 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  25.48 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  28.65 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  33.61 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  24.35 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.01 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  26.89 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  26.57 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  25.45 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  29.61 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  31.88 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  28.04 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  28.98 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  28.11 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  26.35 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  28.21 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  30.71 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  28 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3234  hypothetical protein  32.17 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  28.37 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3372  hypothetical protein  27.4 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2541  protein of unknown function DUF159  29.86 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  32.52 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.03 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  29.86 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  27.56 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  31.67 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>