211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1085 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  38.77 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  33.63 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  33.04 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  33.58 
 
 		 338 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  34.07 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  37.87 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  34.07 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  33.77 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  36 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  37.21 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  34.42 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  32.88 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  33.77 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  33.94 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  34.78 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  34.22 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  35.02 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  32.6 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  32.27 
 
 		 253 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  37.79 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  32.52 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  33.19 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  35.53 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  37.91 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  37.99 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  35.4 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  33.9 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  35.78 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  33.48 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  36.16 
 
 		 254 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  35.09 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  33.05 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  33.18 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  31.86 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0386  hypothetical protein  33.95 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782275  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  38.71 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  34.36 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  32.68 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  30.3 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  33.6 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  35.29 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  32.9 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  33.77 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  31.56 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  30.43 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  32.35 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  35.75 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  34.52 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  33.68 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  31.36 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  32.76 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  30.59 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  34.18 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  37.7 
 
 		 241 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  34.51 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  29.33 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  35 
 
 		 266 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  35 
 
 		 266 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  33.64 
 
 		 242 aa  99  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  33.16 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  35 
 
 		 261 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.24 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  34.3 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  33.94 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  31.09 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  34.33 
 
 		 243 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  32.29 
 
 		 254 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  35.33 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  37.43 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  31.52 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  35.07 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  31.46 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  33.19 
 
 		 257 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  36.2 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  34.55 
 
 		 244 aa  95.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  31.11 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  31.11 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  36 
 
 		 255 aa  94  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  34.08 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  32.47 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  35 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  31.45 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  31.05 
 
 		 253 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1580  hypothetical protein  40.91 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  31.22 
 
 		 261 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  31.6 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  30.99 
 
 		 248 aa  91.7  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  31.6 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  32.03 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  31.6 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  30.49 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  32.04 
 
 		 250 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  30.12 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  30.87 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  30.43 
 
 		 251 aa  89  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  32.61 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  31.88 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>