199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1715 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  99.1 
 
 
222 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  98.2 
 
 
223 aa  454  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  97.3 
 
 
223 aa  448  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  97.3 
 
 
223 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  96.4 
 
 
222 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  84.68 
 
 
223 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  85.39 
 
 
208 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  85.39 
 
 
208 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2031  hypothetical protein  96.48 
 
 
165 aa  293  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  47.39 
 
 
242 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  49.56 
 
 
229 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  47.37 
 
 
239 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  45.78 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  46.52 
 
 
230 aa  194  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  44.78 
 
 
237 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  45.09 
 
 
221 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2941  hypothetical protein  45.09 
 
 
261 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433222  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  45.54 
 
 
229 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  43.67 
 
 
230 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  40.27 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0734  hypothetical protein  47.92 
 
 
147 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1349  hypothetical protein  36.36 
 
 
240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2778  protein of unknown function DUF159  36.84 
 
 
240 aa  134  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  37.39 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1882  hypothetical protein  87.69 
 
 
85 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2209  hypothetical protein  71.76 
 
 
85 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0237306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  33.62 
 
 
255 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
243 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  32.02 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  33.62 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  33.48 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  31.56 
 
 
223 aa  111  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  33.77 
 
 
233 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  33.92 
 
 
257 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.04 
 
 
232 aa  108  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  32.02 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  31.72 
 
 
259 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  35.66 
 
 
261 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  34.98 
 
 
266 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  35.11 
 
 
248 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  30.65 
 
 
233 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  34.98 
 
 
266 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  34.07 
 
 
244 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  31 
 
 
229 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  33.19 
 
 
231 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  33.04 
 
 
239 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  33.2 
 
 
252 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  30.7 
 
 
248 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  31.68 
 
 
268 aa  101  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  32.75 
 
 
222 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  30 
 
 
229 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  30 
 
 
223 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  31.8 
 
 
227 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  31.44 
 
 
225 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  29.39 
 
 
222 aa  99  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  30 
 
 
229 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  31.05 
 
 
253 aa  98.6  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30.09 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  31.76 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  31.3 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  30.67 
 
 
259 aa  95.9  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  32.76 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  29.65 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  30.7 
 
 
238 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  32.5 
 
 
254 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  29.82 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  28.95 
 
 
254 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  31.25 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  34.18 
 
 
246 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  28.8 
 
 
248 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  32.55 
 
 
261 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.65 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  31.36 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  27.75 
 
 
232 aa  92  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  31.37 
 
 
251 aa  91.7  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  31.35 
 
 
254 aa  92  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30.77 
 
 
231 aa  91.7  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  29.96 
 
 
241 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  31.06 
 
 
235 aa  91.7  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  31.6 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  31.6 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  30.6 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  30.86 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  31.65 
 
 
256 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  29.39 
 
 
226 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  30.48 
 
 
281 aa  89.4  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  31.67 
 
 
262 aa  89.4  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  29.54 
 
 
226 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  31.08 
 
 
218 aa  89  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  28.38 
 
 
240 aa  89  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.65 
 
 
242 aa  89  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  31.53 
 
 
234 aa  88.6  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  30.95 
 
 
253 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  30.43 
 
 
268 aa  88.2  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  28.63 
 
 
253 aa  88.2  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  30.83 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  30.24 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  32.53 
 
 
191 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  31.69 
 
 
236 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>