207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16700 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  36.52 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  35.25 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  38.59 
 
 
226 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  37.4 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  39.91 
 
 
222 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  36.36 
 
 
253 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  34.98 
 
 
221 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  32.91 
 
 
233 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  34.78 
 
 
252 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  35.55 
 
 
250 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  34.45 
 
 
222 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  35.43 
 
 
261 aa  121  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  33.93 
 
 
238 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  37.34 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  35.52 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  34.32 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  32.79 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  39.83 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  35.93 
 
 
231 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  36.17 
 
 
221 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  36.4 
 
 
252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  35.08 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  32.37 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  33.47 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  39.89 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  35.29 
 
 
224 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  30.93 
 
 
235 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  36.29 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  33.76 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  32.82 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  32.91 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  31.6 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  31.98 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  36.51 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  28.96 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  34.67 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  31.7 
 
 
261 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  35.23 
 
 
240 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  31.6 
 
 
266 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  31.6 
 
 
266 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  34.6 
 
 
226 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  32.14 
 
 
252 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  34.73 
 
 
254 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  32.57 
 
 
253 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  33.48 
 
 
239 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  32.92 
 
 
244 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  34.78 
 
 
248 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  32.08 
 
 
219 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  32.64 
 
 
247 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  29.63 
 
 
230 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  32.95 
 
 
251 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  34.85 
 
 
259 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  32.63 
 
 
225 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  32.42 
 
 
221 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  32.05 
 
 
268 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  31.23 
 
 
338 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  33.74 
 
 
257 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  101  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  32.89 
 
 
232 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  29.44 
 
 
222 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  33.2 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  33.48 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  29.72 
 
 
224 aa  99  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  33.05 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  31.02 
 
 
231 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  35.71 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  30.23 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  34.8 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  34.31 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  33.19 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  33.68 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  34.02 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  33.61 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  32.76 
 
 
222 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  34.03 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  33.19 
 
 
223 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  28.45 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  32.74 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  31.76 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  34.62 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  31.69 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  33.2 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  33.04 
 
 
223 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  31.56 
 
 
240 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  29.87 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  33.93 
 
 
213 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  30.9 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  31.2 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  29.75 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  30.94 
 
 
274 aa  92.8  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  30.42 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  31.42 
 
 
261 aa  92.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  33.75 
 
 
257 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  34.45 
 
 
241 aa  92  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  33.07 
 
 
233 aa  91.7  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10600  hypothetical protein  33.09 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  33.51 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  36.08 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>