196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2834 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  85.91 
 
 		 221 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2941  hypothetical protein  83.71 
 
 		 261 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433222  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  59.46 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  61.06 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  47.16 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  46.72 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  47.79 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  44.54 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  43.86 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  46.22 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  45.54 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  45.98 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  45.98 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  45.98 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  45.54 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  45.54 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  47.49 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  47.49 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1349  hypothetical protein  35.51 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  42.74 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2778  protein of unknown function DUF159  33.06 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0734  hypothetical protein  46.85 
 
 		 147 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  39.91 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  38.36 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  34.05 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  39.48 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  34.35 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  30.38 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  35.34 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  33.06 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  33.06 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  34.62 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  33.64 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  36.8 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2031  hypothetical protein  44.78 
 
 		 165 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  31.65 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  33.47 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  36.08 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  37.44 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  30.7 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  34.52 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  31.45 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  33.19 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  36.22 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  35.56 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  33.62 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  35.32 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  35.63 
 
 		 250 aa  98.2  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  31.62 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  33.86 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  33.74 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  32.89 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  33.82 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  31.03 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  31.78 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  34.68 
 
 		 253 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  32.64 
 
 		 236 aa  95.5  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  32.02 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  30.34 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  33.07 
 
 		 254 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  30.13 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  34.01 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  32.38 
 
 		 233 aa  94.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  31 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  33.04 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  30.57 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  36.17 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  36.26 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  31.74 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  33.47 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  30.89 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  33.93 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  36.08 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  30.4 
 
 		 253 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  35.29 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  31.03 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  32.14 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  36.51 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  33.5 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  33.8 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  32.58 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  31.37 
 
 		 261 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  32.13 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  30.8 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  33.8 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  33.8 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  32.57 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  35.27 
 
 		 254 aa  88.6  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  34.85 
 
 		 252 aa  88.6  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  33.5 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  33.5 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  34.91 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.13 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.38 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  31.37 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  35.35 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  30.24 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>