204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2952 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  80.51 
 
 		 239 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  68.42 
 
 		 229 aa  340  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  66.23 
 
 		 230 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  53.33 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  49.78 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  47.83 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  47.39 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  47.39 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  47.19 
 
 		 223 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  47.19 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  46.32 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0734  hypothetical protein  62.76 
 
 		 147 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  45.89 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  45.22 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2941  hypothetical protein  46.93 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433222  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  46.29 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  44.35 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  43.86 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2778  protein of unknown function DUF159  38.21 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1349  hypothetical protein  35.92 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  39.79 
 
 		 208 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  39.79 
 
 		 208 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  34.8 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  37.8 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  33.04 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  35.46 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.61 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  33.84 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  33.47 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  34.03 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  36.13 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  33.48 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  35.34 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  32.37 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  34.11 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  34.89 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  34.04 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  35.66 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30.94 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  36.18 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  31.4 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  32.33 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2031  hypothetical protein  41.01 
 
 		 165 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  34.98 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  31.01 
 
 		 274 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  34.19 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  30.47 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  31.06 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  32.26 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  31.02 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.71 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  35.68 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  30.9 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  30.84 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  32.67 
 
 		 253 aa  101  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  35.43 
 
 		 268 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  30.86 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  29.49 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  31.2 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  30.56 
 
 		 261 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  29.18 
 
 		 234 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  33.2 
 
 		 254 aa  99.4  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  33.05 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  30.74 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  32.47 
 
 		 248 aa  98.6  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  29.83 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  35.45 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  30.21 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  32 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  29.74 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  32.49 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  30.71 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  31.44 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  30.25 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  34.4 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  33.19 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  31.76 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  32.08 
 
 		 244 aa  95.1  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  28.81 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  31.2 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  31.11 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0983  hypothetical protein  28.14 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.015485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  30.51 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  30.86 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  31.23 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1143  hypothetical protein  27.71 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284928  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  31.6 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  30.13 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  30.45 
 
 		 338 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  31.68 
 
 		 261 aa  92  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  34.02 
 
 		 248 aa  91.7  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  32.14 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  31.3 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  29.31 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>