220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0853 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
270 aa  547  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  48.16 
 
 
261 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  43.43 
 
 
256 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  44.16 
 
 
253 aa  188  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  40.94 
 
 
251 aa  185  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  42.38 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  41.11 
 
 
250 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  38.58 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  42.91 
 
 
247 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  38.6 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  40.91 
 
 
248 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  39.93 
 
 
253 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  39.78 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  40.74 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  38.35 
 
 
253 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  41.04 
 
 
252 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  39.33 
 
 
226 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  35.66 
 
 
233 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  39 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  39.13 
 
 
231 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  37.64 
 
 
236 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  35.74 
 
 
222 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  36.26 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  38.75 
 
 
338 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  37.13 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  37.37 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  38.64 
 
 
222 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  39.03 
 
 
243 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  39.02 
 
 
221 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  37.08 
 
 
248 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  37.69 
 
 
259 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  35.79 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  32.71 
 
 
235 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  36.23 
 
 
254 aa  139  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  37.74 
 
 
221 aa  138  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  34.05 
 
 
274 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  34.33 
 
 
224 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  37.08 
 
 
259 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  36.14 
 
 
262 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  38.11 
 
 
257 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  36.36 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  37.45 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  34.83 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  34.63 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  33.81 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  41.67 
 
 
252 aa  132  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  32.71 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  37.12 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  39.33 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  35.27 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  36.92 
 
 
238 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  33.58 
 
 
222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  31.12 
 
 
266 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  31.12 
 
 
266 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  32.71 
 
 
222 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  36.03 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  38.57 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  35.02 
 
 
223 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  35.41 
 
 
253 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  35.96 
 
 
246 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  36.26 
 
 
248 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  34.18 
 
 
290 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  34.85 
 
 
252 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  34.57 
 
 
254 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  31.12 
 
 
261 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  29.96 
 
 
232 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  35.77 
 
 
236 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  32 
 
 
255 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  33.58 
 
 
254 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  33.46 
 
 
262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  32.89 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  31.46 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  41.9 
 
 
232 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  32.85 
 
 
233 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  34.3 
 
 
254 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  30.83 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  31.2 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  31.2 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  39.89 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  32.2 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  39.77 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  33.7 
 
 
251 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  31.52 
 
 
248 aa  115  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  33.58 
 
 
227 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  33.94 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10600  hypothetical protein  35.25 
 
 
283 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546903  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  29.34 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  39.39 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  43.6 
 
 
204 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  33.64 
 
 
240 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  33.62 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  35.96 
 
 
231 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  30.42 
 
 
237 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  38.27 
 
 
247 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  40.56 
 
 
221 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  30.41 
 
 
247 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  29.76 
 
 
222 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  40.64 
 
 
229 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  31.97 
 
 
243 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.66 
 
 
240 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>