242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1130 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  527  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  78.38 
 
 		 259 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  71.92 
 
 		 257 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  74.9 
 
 		 257 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  65.25 
 
 		 254 aa  334  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  63.71 
 
 		 255 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  56.52 
 
 		 204 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  54.34 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  51.27 
 
 		 244 aa  234  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  51.83 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  51.11 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  49.33 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  47.9 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  48.89 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  50 
 
 		 254 aa  215  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  43.91 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  43.91 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  46.4 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  45.02 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  44.87 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  44.34 
 
 		 222 aa  195  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  43.51 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  44.39 
 
 		 223 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  45.21 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  47.19 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  38.06 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  45.8 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  41.07 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  46.43 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  42.08 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  37.92 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  41.78 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  42.67 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  40.94 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  41.63 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  39.29 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  38.67 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  47.03 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  42.21 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  39.37 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  38.29 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  42.86 
 
 		 224 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  40.62 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  46.64 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  45.45 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  44.3 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  38.58 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  41.44 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  39.91 
 
 		 222 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  37.67 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  42.11 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  40.56 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  38.96 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  40.09 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  41.82 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  37.16 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  40.09 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  36.48 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  41.1 
 
 		 219 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  38.33 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  39.36 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  40.09 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  41.98 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  36.33 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  37.76 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  40.08 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  37.39 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  44.84 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  35 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  35.45 
 
 		 281 aa  151  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  38.72 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  34.08 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  34.53 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  34.53 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  39.09 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  35.91 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  38.25 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  35.41 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  37.98 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  37.26 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  37.08 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  37.26 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  38.84 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  39.47 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  41.18 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  35.37 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  39.39 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  40.52 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  36.73 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  36.03 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  38.7 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  37.7 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  37.35 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  37.45 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  37.12 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  36.54 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  37.93 
 
 		 236 aa  135  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  37.08 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  34.35 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>