254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1864 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  47.66 
 
 
235 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  46.22 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  46.61 
 
 
224 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  45.13 
 
 
234 aa  206  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  43.44 
 
 
227 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  41.26 
 
 
222 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  40.54 
 
 
221 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  41.2 
 
 
219 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  39.46 
 
 
222 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  38.64 
 
 
223 aa  185  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  39.64 
 
 
224 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  39.48 
 
 
234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  39.73 
 
 
233 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  40.76 
 
 
233 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  40.09 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  37.66 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  39.46 
 
 
224 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  39.64 
 
 
221 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  37.33 
 
 
226 aa  174  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  40 
 
 
222 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  35.75 
 
 
222 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  35.75 
 
 
222 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  35.75 
 
 
222 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  36.44 
 
 
238 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  34.88 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  35.06 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  36.65 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  36.44 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  36.91 
 
 
233 aa  161  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  38.29 
 
 
236 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  35 
 
 
226 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  36.8 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  37.61 
 
 
244 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  36.56 
 
 
225 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  37.73 
 
 
257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  39.44 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  35 
 
 
227 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  32.95 
 
 
290 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  37.62 
 
 
221 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  35.45 
 
 
259 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  36.36 
 
 
257 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  35.91 
 
 
254 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  35.62 
 
 
241 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  35.65 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  39.15 
 
 
255 aa  146  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  33.77 
 
 
232 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  38.18 
 
 
224 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  35 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  34.84 
 
 
213 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  32.92 
 
 
253 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  36.52 
 
 
252 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  34.96 
 
 
243 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  34.96 
 
 
255 aa  141  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  31.69 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  32.3 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  34.3 
 
 
253 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  33.88 
 
 
240 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  33.8 
 
 
254 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  30.83 
 
 
253 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  32.49 
 
 
262 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  32.63 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  32.2 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  32.88 
 
 
243 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  31.86 
 
 
250 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  32.75 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  34.39 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  31.35 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  31.7 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  31.68 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  30.52 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  34.78 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  31.25 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  30.67 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  35.11 
 
 
221 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  33.79 
 
 
218 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  31.33 
 
 
236 aa  124  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  32.21 
 
 
253 aa  124  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  31.03 
 
 
254 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  34.21 
 
 
234 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  30.92 
 
 
262 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  32.31 
 
 
248 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  29.72 
 
 
248 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  34.67 
 
 
197 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  28.4 
 
 
256 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  28.42 
 
 
285 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  31.03 
 
 
254 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  29.92 
 
 
252 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  31.54 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  34.36 
 
 
254 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  33.04 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  33.17 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  31.14 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  27.2 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  30.87 
 
 
231 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  29.39 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  30.23 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  34.76 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  32.44 
 
 
231 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  30.26 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>